218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2729 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 442 aa  897    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 439 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 486 aa  133  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1534  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 414 aa  121  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861998  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  26.91 
 
 		 434 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1523  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00662102  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2675  initiation factor 2  24.61 
 
 		 411 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4068  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 409 aa  108  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3395  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  23.59 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 408 aa  94  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4200  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 416 aa  93.6  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  23.59 
 
 		 412 aa  93.2  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  24.49 
 
 		 500 aa  91.7  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5070  Major facilitator superfamily permease protein  26.17 
 
 		 400 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  22.14 
 
 		 422 aa  90.5  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 434 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 405 aa  86.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  23.49 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  21.96 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0119  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 433 aa  82.8  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0930  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218568  normal  0.0396235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  24.69 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  22.75 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  22.09 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5313  MFS permease  24.12 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  25.9 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 459 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  20.54 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  21.82 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  21.13 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  22.33 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  22.4 
 
 		 416 aa  69.7  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  23.01 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  23.4 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  21.65 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  23.78 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3442  major facilitator superfamily (MFS) transporter  24.11 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  20.66 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  23.31 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5529  major facilitator superfamily MFS_1  22.79 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0196316  hitchhiker  0.00000603603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0639  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0640  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2183  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362785  normal  0.176029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  22.26 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  22.77 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  23.74 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  21.04 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  20.45 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  22.43 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  22.48 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  22.69 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  22.07 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0334  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00118696  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  23.02 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1376  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.757312  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  22.37 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  21.41 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  20.46 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3527  major facilitator transporter  21.87 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  24.6 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  22.68 
 
 		 427 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  21.52 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  22.74 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  22.07 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  22.07 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  20.72 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  22.34 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  23.19 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  22.98 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  22.98 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  20.97 
 
 		 427 aa  57  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0333  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 408 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  22.48 
 
 		 402 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  23.02 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>