42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0639 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0639  major facilitator transporter  100 
 
 		 437 aa  870    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0640  major facilitator transporter  55.1 
 
 		 425 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1376  major facilitator superfamily MFS_1  52.08 
 
 		 439 aa  450  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.757312  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0333  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 408 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  23.19 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  26.06 
 
 		 434 aa  53.5  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5375  phosphoglycerate transporter family protein  25.57 
 
 		 444 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5429  phosphoglycerate transporter family protein  25.57 
 
 		 444 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5051  phosphoglycerate transporter  23.72 
 
 		 444 aa  50.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5109  phosphoglycerate transporter family protein  25.57 
 
 		 444 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4940  glycerol-3-phosphate transporter  25.57 
 
 		 444 aa  50.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5500  phosphoglycerate transporter family protein  25.57 
 
 		 444 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5349  phosphoglycerate transporter family protein  25 
 
 		 444 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4955  glycerol-3-phosphate transporter  25 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  25.74 
 
 		 445 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  25.74 
 
 		 445 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3790  phosphoglycerate transporter  23.56 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5381  phosphoglycerate transporter family protein  25 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 408 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  23.34 
 
 		 427 aa  47.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5573  phosphoglycerate transporter family protein  24.43 
 
 		 444 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 430 aa  47  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  23.63 
 
 		 450 aa  47  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  23.7 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  24.64 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  24.54 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  30.88 
 
 		 478 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03520  conserved hypothetical protein  27.93 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03471  hypothetical protein  27.93 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2627  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 436 aa  44.3  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000092  hexose phosphate transport protein  26.2 
 
 		 442 aa  44.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.149187  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  23.89 
 
 		 430 aa  44.3  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 435 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 442 aa  43.5  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 431 aa  43.1  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>