More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3412 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  100 
 
 		 431 aa  858    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  47.95 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  48 
 
 		 432 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  48.55 
 
 		 440 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  48.55 
 
 		 440 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  46.02 
 
 		 426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  46.02 
 
 		 426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  46.02 
 
 		 426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  42.76 
 
 		 430 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  41.25 
 
 		 428 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  41.25 
 
 		 428 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  41.25 
 
 		 428 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  41.25 
 
 		 428 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  40.77 
 
 		 428 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 429 aa  321  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  41.03 
 
 		 430 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 430 aa  309  8e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  37.73 
 
 		 446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  37.73 
 
 		 458 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  37.96 
 
 		 446 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  37.96 
 
 		 446 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  37.96 
 
 		 458 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  38.48 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  37.73 
 
 		 446 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 		 422 aa  252  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  33.94 
 
 		 436 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  32.44 
 
 		 448 aa  210  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 442 aa  209  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 461 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 449 aa  208  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  32.23 
 
 		 453 aa  208  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 440 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1889  major facilitator family transporter  30.55 
 
 		 435 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000253585  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  31.99 
 
 		 453 aa  206  7e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  31.99 
 
 		 453 aa  206  7e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 		 453 aa  206  7e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 453 aa  206  7e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 453 aa  206  7e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 453 aa  206  7e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 453 aa  206  7e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 469 aa  206  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  32.14 
 
 		 436 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1963  major facilitator family transporter  30.55 
 
 		 435 aa  205  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000192177  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 		 449 aa  205  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 479 aa  205  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 463 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  31.64 
 
 		 448 aa  203  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 463 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 463 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  31.36 
 
 		 434 aa  202  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  30.68 
 
 		 449 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 467 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  31.33 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  30.57 
 
 		 444 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  30.57 
 
 		 444 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  30.57 
 
 		 444 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  30.57 
 
 		 444 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  30.57 
 
 		 444 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  30.57 
 
 		 444 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  30.57 
 
 		 444 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  30.57 
 
 		 444 aa  196  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  30.07 
 
 		 445 aa  196  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 453 aa  196  9e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  29.3 
 
 		 453 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 425 aa  194  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  28.93 
 
 		 452 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  28.93 
 
 		 452 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  28.93 
 
 		 452 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  28.93 
 
 		 452 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  28.93 
 
 		 452 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  28.67 
 
 		 453 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 447 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 447 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 449 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 442 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 447 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0068  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 447 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  33.42 
 
 		 478 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 450 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 455 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5549  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 450 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 444 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 429 aa  189  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  30.62 
 
 		 444 aa  189  9e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  28.89 
 
 		 454 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  31.74 
 
 		 448 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  31.74 
 
 		 448 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  28.89 
 
 		 454 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  31.74 
 
 		 448 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  31.74 
 
 		 448 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 433 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  28.96 
 
 		 454 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>