More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3565 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  100 
 
 		 429 aa  857    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  61.19 
 
 		 430 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  58.11 
 
 		 446 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  56.83 
 
 		 428 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  58.11 
 
 		 458 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  58.78 
 
 		 458 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  61.19 
 
 		 430 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  56.83 
 
 		 428 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  56.59 
 
 		 428 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  56.83 
 
 		 428 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  58.78 
 
 		 446 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  58.19 
 
 		 441 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  58.78 
 
 		 446 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  56.59 
 
 		 428 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  58.29 
 
 		 446 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  55.21 
 
 		 430 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  47.76 
 
 		 426 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  47.29 
 
 		 426 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  47.76 
 
 		 426 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 428 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  42.24 
 
 		 432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 440 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 440 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 431 aa  334  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 		 422 aa  300  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 		 442 aa  251  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 435 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  33 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  34.21 
 
 		 425 aa  225  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.45 
 
 		 460 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 460 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 460 aa  223  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 455 aa  222  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3034  major facilitator family transporter  31.67 
 
 		 450 aa  216  8e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.883875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2955  major facilitator family transporter  31.67 
 
 		 450 aa  216  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3267  major facilitator family transporter  31.67 
 
 		 450 aa  216  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3260  major facilitator family transporter  31.84 
 
 		 451 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 442 aa  212  9e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  31.26 
 
 		 454 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 440 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 446 aa  207  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  31.74 
 
 		 445 aa  206  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 		 443 aa  206  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  31.03 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  31.03 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  31.42 
 
 		 453 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 428 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 432 aa  203  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 439 aa  202  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 434 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  29.75 
 
 		 450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  31.13 
 
 		 444 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  31.13 
 
 		 444 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  31.13 
 
 		 444 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  31.13 
 
 		 444 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  31.13 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  31.13 
 
 		 444 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  31.13 
 
 		 444 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  31.13 
 
 		 444 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  31.14 
 
 		 451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 436 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 436 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 436 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  31.19 
 
 		 452 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  30.21 
 
 		 450 aa  196  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  32 
 
 		 450 aa  196  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  32 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  32 
 
 		 450 aa  196  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  30.07 
 
 		 468 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  32 
 
 		 450 aa  196  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  29 
 
 		 436 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  32 
 
 		 450 aa  196  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  32 
 
 		 450 aa  196  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  31.65 
 
 		 440 aa  195  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  32 
 
 		 450 aa  196  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  31.19 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  31.19 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  31.19 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  29.82 
 
 		 433 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  31.19 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  31.14 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  31.84 
 
 		 463 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 436 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 430 aa  194  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  29.84 
 
 		 450 aa  193  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 432 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 451 aa  192  8e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2845  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 449 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.498164 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  28.5 
 
 		 461 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  30.53 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4133  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 435 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36120  putative MFS transporter  32.99 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263423 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4020  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 435 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  30.11 
 
 		 450 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4990  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 431 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0807  d-galactonate transporter  31.44 
 
 		 450 aa  190  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  28.27 
 
 		 461 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  29.95 
 
 		 444 aa  189  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>