More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2495 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
442 aa  882    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  35.31 
 
 
428 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3034  major facilitator family transporter  33.03 
 
 
450 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.883875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3267  major facilitator family transporter  33.03 
 
 
450 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2955  major facilitator family transporter  33.03 
 
 
450 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3260  major facilitator family transporter  32.81 
 
 
451 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  35.56 
 
 
432 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  35.8 
 
 
440 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  35.8 
 
 
440 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  33.95 
 
 
429 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  31.86 
 
 
428 aa  226  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  31.63 
 
 
428 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  31.63 
 
 
428 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  31.63 
 
 
428 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  31.63 
 
 
428 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0068  major facilitator transporter  30.53 
 
 
447 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274354  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  32.95 
 
 
426 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  32.95 
 
 
426 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  32.95 
 
 
426 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  32.15 
 
 
430 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1963  major facilitator family transporter  31.7 
 
 
435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000192177  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  34.44 
 
 
429 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 
426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  32.55 
 
 
467 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1889  major facilitator family transporter  31.24 
 
 
435 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000253585  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 
429 aa  195  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 
460 aa  193  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.72 
 
 
460 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 
419 aa  192  8e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 
427 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  30.4 
 
 
431 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  32.02 
 
 
430 aa  190  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  28.44 
 
 
428 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 
430 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  31.45 
 
 
446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  31.45 
 
 
458 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  31.45 
 
 
446 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  29 
 
 
428 aa  184  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  31.45 
 
 
458 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  31.45 
 
 
446 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  32.17 
 
 
446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  30.62 
 
 
449 aa  182  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  32.43 
 
 
455 aa  182  8.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  31.92 
 
 
446 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  31.45 
 
 
441 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  29.33 
 
 
452 aa  182  8.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.04 
 
 
456 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  30.33 
 
 
430 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 
449 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0217  d-galactonate transporter  30.75 
 
 
446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  28.21 
 
 
460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0225  d-galactonate transporter  30.75 
 
 
446 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  30.87 
 
 
433 aa  180  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 
433 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  30.58 
 
 
430 aa  179  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  31.05 
 
 
446 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 
449 aa  179  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  29.21 
 
 
447 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 
442 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 
451 aa  178  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  29.7 
 
 
453 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  29.7 
 
 
453 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  29.7 
 
 
453 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  29.21 
 
 
447 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  31 
 
 
463 aa  177  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  29.21 
 
 
447 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  29.84 
 
 
450 aa  176  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  29.84 
 
 
450 aa  176  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  29.23 
 
 
453 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 
422 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 
453 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  29.36 
 
 
448 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  29.23 
 
 
453 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  28.89 
 
 
439 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  28.87 
 
 
453 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  29.23 
 
 
453 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 
433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  29.44 
 
 
445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  27.31 
 
 
438 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  28.47 
 
 
434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  29.61 
 
 
450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  28.51 
 
 
461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  29.93 
 
 
450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  29.31 
 
 
454 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  29.07 
 
 
449 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  29.31 
 
 
454 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  26.68 
 
 
436 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  28.83 
 
 
453 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4215  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 
438 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.528706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  28.73 
 
 
461 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 
432 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  29.36 
 
 
454 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 
431 aa  170  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  28.92 
 
 
435 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2344  major facilitator transporter  32.41 
 
 
449 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  26.62 
 
 
436 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0202  d-galactonate transporter  30.68 
 
 
446 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317635  unclonable  0.00000000000905697 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  29.25 
 
 
448 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  28.5 
 
 
444 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 
453 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>