More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3641 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  100 
 
 		 453 aa  922    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 453 aa  922    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  91.39 
 
 		 449 aa  852    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  99.34 
 
 		 453 aa  919    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  922    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  99.34 
 
 		 453 aa  919    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  99.34 
 
 		 453 aa  917    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  90.29 
 
 		 449 aa  842    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  99.78 
 
 		 453 aa  921    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  99.34 
 
 		 453 aa  919    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  76.61 
 
 		 452 aa  721    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  55.84 
 
 		 427 aa  480  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  43.02 
 
 		 450 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  42.09 
 
 		 436 aa  346  5e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  41.59 
 
 		 439 aa  329  6e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  41.59 
 
 		 439 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  41.59 
 
 		 439 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  41.36 
 
 		 439 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  42.28 
 
 		 440 aa  326  6e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 438 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  39.62 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  42.69 
 
 		 437 aa  323  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 439 aa  323  6e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 439 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  39.57 
 
 		 436 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  41.13 
 
 		 439 aa  315  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  37.75 
 
 		 447 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  37.82 
 
 		 447 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  39.52 
 
 		 431 aa  296  5e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  37.88 
 
 		 432 aa  295  9e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 447 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  38.53 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  34.91 
 
 		 436 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 436 aa  239  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 		 425 aa  236  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 436 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 436 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 436 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 442 aa  227  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.28 
 
 		 456 aa  224  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  33.03 
 
 		 458 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  33.57 
 
 		 448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  31.55 
 
 		 436 aa  212  9e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 449 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  34.48 
 
 		 448 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  34.48 
 
 		 448 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  34.48 
 
 		 448 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  34.48 
 
 		 448 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  34.48 
 
 		 448 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  34.48 
 
 		 448 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  34.48 
 
 		 448 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 447 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 447 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 450 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 467 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  30.09 
 
 		 436 aa  206  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  30.14 
 
 		 448 aa  206  7e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 447 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 419 aa  206  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  30.18 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  30.18 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  30.18 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  30.18 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  30.18 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  30.18 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 455 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  30.72 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  30.18 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 466 aa  202  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 443 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  30.84 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  29.72 
 
 		 454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  29.72 
 
 		 454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  30.58 
 
 		 434 aa  201  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 479 aa  200  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  31.46 
 
 		 478 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 431 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 463 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  30.24 
 
 		 469 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  30.07 
 
 		 447 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  31 
 
 		 454 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  30 
 
 		 461 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  29.74 
 
 		 444 aa  195  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  31 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 463 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 463 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 464 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  29.4 
 
 		 453 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  29.18 
 
 		 429 aa  192  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  29.55 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2845  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 449 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.498164 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4084  probable glucarate transporter  29.72 
 
 		 436 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.463281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4023  glucarate transporter  29.72 
 
 		 436 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.957782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  30.14 
 
 		 432 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  30.14 
 
 		 432 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>