More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8222 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 422 aa  822    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 426 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  38.72 
 
 		 426 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  38.72 
 
 		 426 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  39.23 
 
 		 430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  39.23 
 
 		 428 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  39.23 
 
 		 428 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  39.23 
 
 		 428 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  39.23 
 
 		 428 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  39.23 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  38.83 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 440 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 440 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  38.87 
 
 		 432 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 428 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  36.34 
 
 		 446 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  36.34 
 
 		 446 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  36.34 
 
 		 458 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  36.34 
 
 		 441 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  36.09 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 430 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  36.09 
 
 		 458 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  37.63 
 
 		 430 aa  249  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 431 aa  247  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  36.34 
 
 		 446 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 430 aa  209  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 		 425 aa  203  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 433 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1889  major facilitator family transporter  30.87 
 
 		 435 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000253585  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 433 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_004310  BR1963  major facilitator family transporter  30.87 
 
 		 435 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000192177  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 		 433 aa  190  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 430 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 		 429 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 429 aa  187  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 454 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 440 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  31.8 
 
 		 460 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  30.48 
 
 		 454 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  30.48 
 
 		 454 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 435 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  30.24 
 
 		 454 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 460 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.55 
 
 		 460 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 446 aa  182  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 433 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  30.26 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  32.51 
 
 		 445 aa  179  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 436 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 442 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  29.14 
 
 		 448 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 453 aa  178  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 455 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 436 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 436 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 436 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0068  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 447 aa  176  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3034  major facilitator family transporter  30.05 
 
 		 450 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.883875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3267  major facilitator family transporter  30.05 
 
 		 450 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  30.5 
 
 		 450 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 449 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  30.9 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  30.9 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2955  major facilitator family transporter  29.8 
 
 		 450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  30.9 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  30.9 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  30.9 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  30.9 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  30.9 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  30.9 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3260  major facilitator family transporter  29.8 
 
 		 451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 432 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  30.07 
 
 		 453 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 436 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  31.62 
 
 		 451 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  30.45 
 
 		 450 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 426 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  30.2 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  32.28 
 
 		 433 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  28.57 
 
 		 447 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 432 aa  170  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  26.47 
 
 		 453 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 453 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  29.24 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3397  D-galactonate transporter  30.5 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 423 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  26.47 
 
 		 453 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 423 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  26.47 
 
 		 453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.93 
 
 		 433 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 452 aa  166  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4990  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 431 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214245  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  28.24 
 
 		 461 aa  163  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>