More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4428 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  100 
 
 		 428 aa  838    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  94.85 
 
 		 440 aa  761    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  94.85 
 
 		 440 aa  761    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  88.66 
 
 		 432 aa  723    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  50.12 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  47.95 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  47.03 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  47.03 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  46.68 
 
 		 426 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  43.86 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  43.86 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  43.86 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  43.61 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  43.61 
 
 		 428 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  43.54 
 
 		 458 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  43.54 
 
 		 446 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  42.82 
 
 		 446 aa  345  7e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  42.82 
 
 		 446 aa  345  7e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  42.82 
 
 		 458 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  43.32 
 
 		 441 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  46.28 
 
 		 430 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  45.64 
 
 		 430 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 429 aa  342  8e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  43.83 
 
 		 446 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  36.91 
 
 		 422 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 		 425 aa  239  9e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 		 442 aa  238  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 430 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 435 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2955  major facilitator family transporter  31.62 
 
 		 450 aa  229  8e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3260  major facilitator family transporter  31.62 
 
 		 451 aa  229  9e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3034  major facilitator family transporter  31.37 
 
 		 450 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.883875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3267  major facilitator family transporter  31.37 
 
 		 450 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  32.85 
 
 		 448 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 463 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 469 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 446 aa  219  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 463 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 463 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  33.96 
 
 		 456 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 467 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 479 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 464 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  32.86 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  33.58 
 
 		 449 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 461 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  32.55 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  33.57 
 
 		 446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 429 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 447 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0068  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 447 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 446 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 460 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 447 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 447 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  32.32 
 
 		 436 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  34.05 
 
 		 448 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 436 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  34.69 
 
 		 450 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  33.65 
 
 		 436 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  33.65 
 
 		 436 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  33.65 
 
 		 436 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  35.66 
 
 		 443 aa  210  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 455 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 436 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 449 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  34.45 
 
 		 450 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.68 
 
 		 460 aa  209  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 		 429 aa  209  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  34.69 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  34.69 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  34.69 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  34.69 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  34.69 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  34.69 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  34.69 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  32.25 
 
 		 450 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_004310  BR1963  major facilitator family transporter  32.46 
 
 		 435 aa  207  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000192177  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1889  major facilitator family transporter  32.07 
 
 		 435 aa  206  6e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000253585  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 432 aa  206  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 460 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 458 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  33.17 
 
 		 445 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  34.32 
 
 		 419 aa  203  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 442 aa  202  8e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  32.27 
 
 		 427 aa  202  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 		 434 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  31.31 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 452 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 449 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  32.63 
 
 		 478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  31.07 
 
 		 454 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 		 433 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  30.96 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>