More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4153 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  100 
 
 
436 aa  846    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  93.12 
 
 
436 aa  792    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  94.27 
 
 
436 aa  799    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  94.27 
 
 
436 aa  799    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  94.27 
 
 
436 aa  799    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  62 
 
 
428 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  62.36 
 
 
436 aa  526  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  58.95 
 
 
443 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  48.69 
 
 
425 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  46.74 
 
 
446 aa  385  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  42.58 
 
 
448 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  40.65 
 
 
435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  38.3 
 
 
432 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  38.37 
 
 
446 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  38.37 
 
 
446 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  38.61 
 
 
449 aa  276  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  39.95 
 
 
436 aa  274  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  39.01 
 
 
436 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  36.47 
 
 
467 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  39.53 
 
 
478 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  36.71 
 
 
454 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  36.02 
 
 
463 aa  262  6.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  36.71 
 
 
442 aa  261  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  38.08 
 
 
468 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  36.26 
 
 
453 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 
431 aa  259  7e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  35.83 
 
 
454 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  36.07 
 
 
461 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  36.07 
 
 
461 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  35.83 
 
 
454 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.24 
 
 
456 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  34.88 
 
 
466 aa  257  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  40.14 
 
 
434 aa  257  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  37.44 
 
 
429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  34.72 
 
 
438 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  37.94 
 
 
450 aa  252  7e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 
419 aa  252  8.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  35.42 
 
 
450 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 
449 aa  251  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  36.1 
 
 
430 aa  249  5e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  36.68 
 
 
445 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  36.1 
 
 
430 aa  249  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  36.1 
 
 
430 aa  249  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  36.1 
 
 
445 aa  249  5e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  36.1 
 
 
445 aa  249  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  35.83 
 
 
447 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  35.83 
 
 
447 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 
449 aa  249  9e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  35.31 
 
 
450 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  35.87 
 
 
430 aa  247  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  35.87 
 
 
430 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  35.87 
 
 
430 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  35.32 
 
 
428 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  35.32 
 
 
428 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  35.6 
 
 
447 aa  246  8e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  35.08 
 
 
428 aa  246  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0187  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  37.91 
 
 
451 aa  245  9e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  34.91 
 
 
453 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 
453 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6596  d-galactonate transporter  36.34 
 
 
457 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143418  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2344  major facilitator transporter  35.88 
 
 
449 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  34.91 
 
 
453 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  34.91 
 
 
453 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  34.91 
 
 
453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  34.91 
 
 
453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  34.91 
 
 
453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  35.42 
 
 
452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  34.91 
 
 
453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  35.03 
 
 
449 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  35.63 
 
 
454 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  34.99 
 
 
448 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  34.68 
 
 
432 aa  243  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  34.68 
 
 
432 aa  243  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  34.71 
 
 
450 aa  242  7.999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  36.7 
 
 
454 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2845  major facilitator transporter  35.8 
 
 
449 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.498164 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  34.68 
 
 
432 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  35.17 
 
 
454 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  35.42 
 
 
450 aa  241  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  35.17 
 
 
454 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6079  major facilitator transporter  34.69 
 
 
413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4215  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 
438 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.528706 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  34.56 
 
 
455 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  34.63 
 
 
444 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  34.63 
 
 
444 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  34.63 
 
 
444 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  34.63 
 
 
444 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  34.63 
 
 
444 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  34.63 
 
 
444 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  34.63 
 
 
444 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  37.65 
 
 
479 aa  239  8e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  36.89 
 
 
451 aa  239  9e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  37.65 
 
 
461 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  34.63 
 
 
444 aa  239  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  37.88 
 
 
469 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  34.63 
 
 
444 aa  237  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  37.59 
 
 
463 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  37.88 
 
 
464 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  35.43 
 
 
447 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  35.94 
 
 
451 aa  236  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>