More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1357 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  97.02 
 
 
436 aa  830    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  100 
 
 
436 aa  851    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  97.02 
 
 
436 aa  830    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  93.12 
 
 
436 aa  792    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  97.02 
 
 
436 aa  830    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  61.36 
 
 
428 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  61.56 
 
 
436 aa  523  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  58.95 
 
 
443 aa  471  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  49.76 
 
 
425 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  46.56 
 
 
446 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  40.23 
 
 
448 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  40.1 
 
 
435 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  38.1 
 
 
432 aa  276  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  39.48 
 
 
436 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  37.41 
 
 
446 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  37.41 
 
 
446 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  38.95 
 
 
436 aa  272  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  37.41 
 
 
449 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  36.12 
 
 
454 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  40.48 
 
 
434 aa  266  5e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  35.89 
 
 
453 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  39.9 
 
 
478 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  35.6 
 
 
454 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  36.65 
 
 
468 aa  263  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  35.6 
 
 
454 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  36.41 
 
 
463 aa  262  8e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  35.75 
 
 
461 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  35.07 
 
 
461 aa  259  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  36.49 
 
 
442 aa  258  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  35.39 
 
 
467 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  38.76 
 
 
431 aa  258  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.24 
 
 
456 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  34.38 
 
 
466 aa  256  8e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  35.87 
 
 
429 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  36.45 
 
 
445 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  36.64 
 
 
450 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  35.87 
 
 
445 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  35.87 
 
 
445 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  35.71 
 
 
430 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  35.71 
 
 
430 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  35.87 
 
 
430 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  34.52 
 
 
450 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 
419 aa  250  4e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  35.63 
 
 
430 aa  249  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  35.63 
 
 
430 aa  249  7e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  35.63 
 
 
430 aa  249  7e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  35.49 
 
 
452 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 
449 aa  248  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 
449 aa  247  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  35.87 
 
 
448 aa  246  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  35.17 
 
 
428 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  34.73 
 
 
450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4215  major facilitator superfamily MFS_1  35.15 
 
 
438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.528706 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  36.66 
 
 
458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  35.42 
 
 
450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  37.47 
 
 
451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  34.97 
 
 
450 aa  244  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2344  major facilitator transporter  34.81 
 
 
449 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  33.97 
 
 
432 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  33.97 
 
 
432 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  33.97 
 
 
432 aa  243  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  32.53 
 
 
453 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0187  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  36.83 
 
 
451 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  34.75 
 
 
447 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6596  d-galactonate transporter  35.21 
 
 
457 aa  242  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143418  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  34.58 
 
 
449 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  34.75 
 
 
447 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  33.49 
 
 
438 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6079  major facilitator transporter  34.77 
 
 
413 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  34.69 
 
 
428 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  34.69 
 
 
428 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  34.88 
 
 
454 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  34.66 
 
 
453 aa  239  8e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  34.66 
 
 
453 aa  239  8e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  34.66 
 
 
453 aa  239  8e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  34.67 
 
 
447 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  34.66 
 
 
453 aa  239  8e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  34.66 
 
 
453 aa  239  8e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 
453 aa  239  9e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  37.41 
 
 
461 aa  239  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  34.66 
 
 
453 aa  239  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  34.66 
 
 
453 aa  239  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  34.66 
 
 
453 aa  239  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  35.9 
 
 
454 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  34.88 
 
 
454 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  37.65 
 
 
469 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  34.88 
 
 
454 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  37.65 
 
 
464 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  37.18 
 
 
479 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  33.72 
 
 
455 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 
458 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  33.64 
 
 
447 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  37.12 
 
 
463 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.503182 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  34.64 
 
 
444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  34.64 
 
 
444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  34.04 
 
 
451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4735  galactarate transporter  35.58 
 
 
453 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388057  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  34.64 
 
 
444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  34.64 
 
 
444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  34.64 
 
 
444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>