More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2645 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  100 
 
 		 466 aa  939    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  54.04 
 
 		 442 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  54.93 
 
 		 436 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  54.35 
 
 		 436 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  53.19 
 
 		 434 aa  458  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  53.88 
 
 		 478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  50.23 
 
 		 461 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  50.46 
 
 		 469 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  50.95 
 
 		 463 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  49.32 
 
 		 479 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  50 
 
 		 464 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  50.95 
 
 		 463 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  50.95 
 
 		 463 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  46.88 
 
 		 429 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  45.92 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  45.92 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  45.92 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  46.01 
 
 		 445 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  46.01 
 
 		 430 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  46.24 
 
 		 430 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  46.01 
 
 		 430 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  46.01 
 
 		 445 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  45.77 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  45.77 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  45.77 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  48 
 
 		 430 aa  395  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0010  d-galactonate transporter  46.59 
 
 		 430 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.661181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  41.55 
 
 		 448 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.24 
 
 		 456 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  40.45 
 
 		 447 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  40.22 
 
 		 447 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  40.22 
 
 		 447 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  40.69 
 
 		 467 aa  352  8e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  40.6 
 
 		 449 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  40.09 
 
 		 450 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  40.68 
 
 		 455 aa  347  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  41.37 
 
 		 444 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  41.23 
 
 		 458 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  41.04 
 
 		 448 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  41.04 
 
 		 448 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  41.04 
 
 		 448 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  41.04 
 
 		 448 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  41.04 
 
 		 448 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  41.04 
 
 		 448 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  41.04 
 
 		 448 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  38.58 
 
 		 428 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  39.63 
 
 		 428 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  39.63 
 
 		 428 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  36.72 
 
 		 463 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  38.02 
 
 		 454 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  38.02 
 
 		 454 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  38.02 
 
 		 454 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  38.71 
 
 		 455 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  38.32 
 
 		 446 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  38.52 
 
 		 447 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  38.59 
 
 		 446 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  38.02 
 
 		 454 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4215  major facilitator superfamily MFS_1  37.85 
 
 		 438 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.528706 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6079  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 413 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  37.07 
 
 		 449 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  35.87 
 
 		 451 aa  317  3e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  38.53 
 
 		 453 aa  316  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  38.15 
 
 		 438 aa  315  9e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  36.16 
 
 		 452 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  38.88 
 
 		 445 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  35.9 
 
 		 454 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  35.9 
 
 		 454 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  35.9 
 
 		 454 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  35.93 
 
 		 452 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  35.93 
 
 		 452 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  35.93 
 
 		 452 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  35.93 
 
 		 452 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  38.98 
 
 		 447 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6596  d-galactonate transporter  39.82 
 
 		 457 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143418  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  35.65 
 
 		 450 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  35.65 
 
 		 450 aa  311  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  35.65 
 
 		 450 aa  311  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  35.65 
 
 		 450 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  35.65 
 
 		 450 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  35.65 
 
 		 450 aa  311  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  35.65 
 
 		 450 aa  311  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  36.88 
 
 		 450 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  35.65 
 
 		 450 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  36.67 
 
 		 450 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  37.19 
 
 		 461 aa  309  8e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  35.94 
 
 		 440 aa  308  9e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  36.38 
 
 		 453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  36.61 
 
 		 461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  36.53 
 
 		 444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  36.53 
 
 		 444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  36.53 
 
 		 444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  36.53 
 
 		 444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  36.53 
 
 		 444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  36.53 
 
 		 444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  36.53 
 
 		 444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  36.59 
 
 		 444 aa  306  6e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  37.7 
 
 		 451 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3397  D-galactonate transporter  37.42 
 
 		 446 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  36.28 
 
 		 468 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  38.17 
 
 		 453 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>