More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4628 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  95.97 
 
 		 447 aa  846    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  74.07 
 
 		 454 aa  653    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  73.6 
 
 		 455 aa  649    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  73.83 
 
 		 454 aa  648    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  73.83 
 
 		 454 aa  649    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  100 
 
 		 447 aa  895    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  73.83 
 
 		 454 aa  648    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  54.69 
 
 		 452 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  54.69 
 
 		 452 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  54.69 
 
 		 452 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  54.69 
 
 		 452 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  54.69 
 
 		 452 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  53.99 
 
 		 451 aa  504  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  53.76 
 
 		 450 aa  501  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  53.76 
 
 		 450 aa  501  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  53.76 
 
 		 450 aa  501  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  53.76 
 
 		 450 aa  499  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  53.76 
 
 		 450 aa  501  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  53.76 
 
 		 450 aa  501  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  53.76 
 
 		 440 aa  500  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  54.46 
 
 		 463 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  53.76 
 
 		 450 aa  501  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  53.76 
 
 		 450 aa  501  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  55.87 
 
 		 450 aa  495  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  54.01 
 
 		 454 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  54.01 
 
 		 454 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  53.61 
 
 		 461 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  53.85 
 
 		 461 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  53.77 
 
 		 468 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  54.3 
 
 		 450 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  54.01 
 
 		 454 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  52.13 
 
 		 450 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  51.69 
 
 		 450 aa  490  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  53.27 
 
 		 445 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6596  d-galactonate transporter  53.29 
 
 		 457 aa  487  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  51.64 
 
 		 485 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  54.75 
 
 		 450 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  53.77 
 
 		 453 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  51.64 
 
 		 485 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  53.5 
 
 		 458 aa  480  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  52.79 
 
 		 444 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  52.79 
 
 		 444 aa  476  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  52.79 
 
 		 444 aa  476  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  52.79 
 
 		 444 aa  476  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  52.79 
 
 		 444 aa  476  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0327  D-galactonate transporter  52.2 
 
 		 459 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  52.79 
 
 		 444 aa  476  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  52.79 
 
 		 444 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  53.81 
 
 		 458 aa  478  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  52.79 
 
 		 444 aa  476  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0807  d-galactonate transporter  52.8 
 
 		 450 aa  474  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  51.23 
 
 		 451 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0841  d-galactonate transporter  52.36 
 
 		 450 aa  472  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4735  galactarate transporter  53.86 
 
 		 453 aa  474  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388057  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  51.69 
 
 		 444 aa  474  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  53.24 
 
 		 450 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  53.24 
 
 		 450 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0187  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  53.6 
 
 		 451 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3044  D-galactonate transporter  51.65 
 
 		 464 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5322  d-galactonate transporter  51.65 
 
 		 464 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4946  d-galactonate transporter  52.8 
 
 		 435 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.899086  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3397  D-galactonate transporter  50.68 
 
 		 446 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0217  d-galactonate transporter  50.68 
 
 		 446 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0225  d-galactonate transporter  50.68 
 
 		 446 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305819 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0202  d-galactonate transporter  50.68 
 
 		 446 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317635  unclonable  0.00000000000905697 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0277  d-galactonate transporter  51.13 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1217  d-galactonate transporter  49.88 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26743  normal  0.06903 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2810  D-galactonate transporter  51.13 
 
 		 446 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0296  d-galactonate transporter  51.13 
 
 		 446 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106935  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  44.84 
 
 		 438 aa  401  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3916  probable glucarate transporter  45.07 
 
 		 436 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4084  probable glucarate transporter  45.07 
 
 		 436 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.463281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3978  putative glucarate transporter  45.07 
 
 		 436 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.776069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4023  glucarate transporter  45.07 
 
 		 436 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.957782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  42.96 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  43.19 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  44.13 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  43.9 
 
 		 446 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  44.13 
 
 		 449 aa  372  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  42.72 
 
 		 478 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  42.66 
 
 		 442 aa  363  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 461 aa  361  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  42.66 
 
 		 464 aa  359  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 463 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  41.7 
 
 		 479 aa  359  6e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  40.96 
 
 		 430 aa  359  6e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  40.95 
 
 		 434 aa  358  8e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  42.66 
 
 		 469 aa  358  9e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 463 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 463 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  40.86 
 
 		 445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  40.86 
 
 		 445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  40.96 
 
 		 430 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  40.96 
 
 		 430 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  40.96 
 
 		 430 aa  356  5e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  40.96 
 
 		 430 aa  356  5e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  40.89 
 
 		 447 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  40.89 
 
 		 447 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  40.44 
 
 		 447 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  40.67 
 
 		 432 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>