More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4127 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 432 aa  865    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  79.53 
 
 		 431 aa  668    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 438 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  39.12 
 
 		 449 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  39.53 
 
 		 436 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  38.89 
 
 		 449 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  38.9 
 
 		 436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  38.88 
 
 		 427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  38.37 
 
 		 450 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 452 aa  300  5e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  37.88 
 
 		 453 aa  296  4e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  36.88 
 
 		 447 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  37.88 
 
 		 453 aa  295  7e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  37.88 
 
 		 453 aa  295  8e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  37.88 
 
 		 453 aa  295  8e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  37.88 
 
 		 453 aa  295  8e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  37.88 
 
 		 453 aa  295  8e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  37.88 
 
 		 453 aa  295  8e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  37.88 
 
 		 453 aa  295  8e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  37.65 
 
 		 447 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  39.09 
 
 		 439 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  36.93 
 
 		 447 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 440 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  38.06 
 
 		 439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 439 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 439 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 436 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 436 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 436 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  38.3 
 
 		 436 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 436 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  40.28 
 
 		 439 aa  276  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 439 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 431 aa  270  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 428 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  34.19 
 
 		 446 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  33.95 
 
 		 446 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 		 442 aa  259  5.0000000000000005e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 446 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 467 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 447 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 447 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 447 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  33.57 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  35 
 
 		 469 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 479 aa  254  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  33.41 
 
 		 449 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  35.61 
 
 		 434 aa  253  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  34.4 
 
 		 464 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  36.21 
 
 		 425 aa  253  5.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  33.1 
 
 		 454 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  33.1 
 
 		 454 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 463 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 449 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  35.09 
 
 		 436 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  36.06 
 
 		 448 aa  252  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  35.93 
 
 		 444 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  35.93 
 
 		 444 aa  250  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  35.93 
 
 		 444 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  35.93 
 
 		 444 aa  250  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  35.93 
 
 		 444 aa  250  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  35.93 
 
 		 444 aa  250  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  35.93 
 
 		 444 aa  250  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 450 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 463 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 463 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 454 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  36.19 
 
 		 444 aa  249  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 461 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  36.75 
 
 		 436 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  34.52 
 
 		 448 aa  247  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 444 aa  247  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 455 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  33.02 
 
 		 447 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  33.03 
 
 		 450 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 455 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  32.79 
 
 		 454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  32.79 
 
 		 454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  35.01 
 
 		 443 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  32.55 
 
 		 454 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  37.05 
 
 		 444 aa  243  6e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  33.02 
 
 		 453 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 435 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  33.49 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  32.48 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  33.49 
 
 		 453 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  34.63 
 
 		 478 aa  240  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  32.5 
 
 		 447 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  33.49 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  33.49 
 
 		 456 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4735  galactarate transporter  34.26 
 
 		 453 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388057  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  36.63 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  36.63 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  36.63 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  36.63 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  36.63 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  32.17 
 
 		 485 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>