More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5810 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  97.02 
 
 		 436 aa  830    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  100 
 
 		 436 aa  845    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  100 
 
 		 436 aa  845    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  100 
 
 		 436 aa  845    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  94.27 
 
 		 436 aa  799    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  61.78 
 
 		 436 aa  521  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  61.81 
 
 		 428 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  58.95 
 
 		 443 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  47.27 
 
 		 446 aa  381  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  41.53 
 
 		 448 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 435 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  38.57 
 
 		 432 aa  278  9e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  37.89 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  39.72 
 
 		 436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  37.89 
 
 		 446 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  39.43 
 
 		 436 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  37.89 
 
 		 449 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  37.25 
 
 		 468 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  41.33 
 
 		 434 aa  266  5e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  35.89 
 
 		 453 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  40.14 
 
 		 478 aa  266  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  35.63 
 
 		 463 aa  265  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  35.89 
 
 		 454 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  35.97 
 
 		 461 aa  262  8e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  36.9 
 
 		 467 aa  262  8e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  35.37 
 
 		 454 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  35.37 
 
 		 454 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  35.29 
 
 		 461 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  38.76 
 
 		 431 aa  259  9e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  36.49 
 
 		 442 aa  258  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.24 
 
 		 456 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  36.34 
 
 		 429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  37.56 
 
 		 450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  36.58 
 
 		 430 aa  254  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  36.58 
 
 		 430 aa  254  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  36.45 
 
 		 445 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  36.58 
 
 		 430 aa  253  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  36.58 
 
 		 445 aa  253  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  36.58 
 
 		 445 aa  253  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  36.58 
 
 		 430 aa  252  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  36.34 
 
 		 430 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  36.34 
 
 		 430 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  35.49 
 
 		 419 aa  249  5e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  34.72 
 
 		 450 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  36.1 
 
 		 448 aa  247  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  34.89 
 
 		 449 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  35.39 
 
 		 428 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 		 449 aa  246  9e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  35.17 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4215  major facilitator superfamily MFS_1  35.63 
 
 		 438 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.528706 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  34.94 
 
 		 450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  34.92 
 
 		 432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0187  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  37.76 
 
 		 451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  34.92 
 
 		 432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  37.94 
 
 		 451 aa  244  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 449 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  35.46 
 
 		 447 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2344  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 449 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  35.46 
 
 		 447 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  34.92 
 
 		 432 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  33.04 
 
 		 453 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  34.72 
 
 		 450 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6596  d-galactonate transporter  35.44 
 
 		 457 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  35.38 
 
 		 447 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  33.49 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6079  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 413 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  36.43 
 
 		 458 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  35.35 
 
 		 454 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 428 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 428 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 453 aa  239  5.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  35.35 
 
 		 454 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  34.4 
 
 		 455 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  35.35 
 
 		 454 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 454 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  37.88 
 
 		 461 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 453 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  34.66 
 
 		 453 aa  237  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  34.66 
 
 		 453 aa  237  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  34.66 
 
 		 453 aa  237  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 450 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  34.66 
 
 		 453 aa  237  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 464 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 479 aa  237  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 453 aa  236  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  34.63 
 
 		 451 aa  237  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 453 aa  236  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 453 aa  236  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 463 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  34.63 
 
 		 450 aa  236  8e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 		 458 aa  236  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  34.63 
 
 		 450 aa  236  8e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  34.11 
 
 		 447 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2845  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 449 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.498164 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  34.87 
 
 		 444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  34.87 
 
 		 444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>