More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1401 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
434 aa  875    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  30.02 
 
 
428 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  29.79 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  29.79 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  29.79 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  29.55 
 
 
428 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  31.39 
 
 
428 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  30.7 
 
 
448 aa  193  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  29.27 
 
 
429 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 
430 aa  186  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  31.39 
 
 
440 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  31.39 
 
 
440 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  28.61 
 
 
435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  29.14 
 
 
426 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  28.71 
 
 
426 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  28.71 
 
 
426 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  27.67 
 
 
436 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  27.65 
 
 
446 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  27.23 
 
 
436 aa  173  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  26.74 
 
 
436 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  26.74 
 
 
436 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  26.74 
 
 
436 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  27.65 
 
 
458 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 
460 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  26.76 
 
 
440 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.98 
 
 
460 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  27.65 
 
 
458 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  27.65 
 
 
446 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  27.25 
 
 
424 aa  170  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  27.65 
 
 
441 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  27.65 
 
 
446 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  27.74 
 
 
428 aa  170  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  29.82 
 
 
432 aa  169  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  26.54 
 
 
446 aa  169  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  27.4 
 
 
460 aa  166  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  30.52 
 
 
455 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 
427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  26.53 
 
 
430 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  28.18 
 
 
430 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 
425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  29.06 
 
 
433 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  29.19 
 
 
432 aa  163  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 
431 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  28.2 
 
 
429 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  27.9 
 
 
446 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5920  major facilitator transporter  27.85 
 
 
435 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0977977  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  26.76 
 
 
430 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  27.27 
 
 
436 aa  160  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  26.56 
 
 
450 aa  160  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 
422 aa  159  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  28.57 
 
 
430 aa  159  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2535  major facilitator transporter  24.94 
 
 
425 aa  158  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2587  major facilitator transporter  24.94 
 
 
425 aa  158  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  29.43 
 
 
409 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 
449 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 
429 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  26.19 
 
 
453 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 
449 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  26.21 
 
 
428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 
443 aa  154  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4224  putative permease  29.52 
 
 
420 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  27.07 
 
 
427 aa  153  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 
449 aa  152  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  26.29 
 
 
449 aa  152  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  25.74 
 
 
454 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4020  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 
435 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  26.32 
 
 
450 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4133  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 
435 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4117  putative permease  29.29 
 
 
420 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 
442 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4044  putative permease  28.4 
 
 
420 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  26.62 
 
 
452 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  26.32 
 
 
431 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  26.82 
 
 
463 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  25.62 
 
 
454 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  25.62 
 
 
454 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4990  major facilitator transporter  27.59 
 
 
431 aa  149  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214245  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 
426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  24.08 
 
 
458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 
442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4166  putative permease  29.29 
 
 
420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  24.83 
 
 
450 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  28.13 
 
 
433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4735  galactarate transporter  24.83 
 
 
453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388057  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  28.4 
 
 
423 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  24.37 
 
 
453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 
433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  28.4 
 
 
423 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  27.23 
 
 
451 aa  146  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2672  major facilitator transporter  27.32 
 
 
433 aa  146  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529284  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  24.94 
 
 
450 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 
426 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  25.99 
 
 
467 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  25.11 
 
 
461 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  25.25 
 
 
446 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2927  MFS family transporter: sugar  27.54 
 
 
429 aa  142  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.027105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  25.25 
 
 
446 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  27.03 
 
 
437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>