More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0231 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  100 
 
 		 409 aa  813    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3235  major facilitator superfamily MFS_1  53.44 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0884  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 394 aa  289  7e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 417 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3710  major facilitator superfamily MFS_1  34.37 
 
 		 408 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.010262 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  28.11 
 
 		 448 aa  164  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.1 
 
 		 460 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 423 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 423 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 430 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 434 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8624  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 		 461 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.860223  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 460 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 432 aa  156  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  29.38 
 
 		 433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  28.04 
 
 		 427 aa  154  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 431 aa  153  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4133  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4020  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  29.09 
 
 		 453 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  29.93 
 
 		 468 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0477  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  28.8 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 449 aa  146  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  28.85 
 
 		 454 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  28.85 
 
 		 454 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  29.33 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  27.29 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  26.82 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  26.82 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  27.14 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4280  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  27.29 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  29.44 
 
 		 463 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  26.65 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 430 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  27.29 
 
 		 441 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 425 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 429 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  26.65 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  26.65 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 432 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  27.29 
 
 		 458 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 440 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 440 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 440 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 453 aa  144  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 453 aa  144  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 453 aa  144  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 428 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 430 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  27.23 
 
 		 453 aa  143  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 432 aa  143  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  26.65 
 
 		 428 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 439 aa  143  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  26.96 
 
 		 453 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 453 aa  142  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  27.89 
 
 		 461 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 453 aa  143  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  26.96 
 
 		 453 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  27.29 
 
 		 446 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 426 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8658  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  28.02 
 
 		 461 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 426 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  29.31 
 
 		 454 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  29.31 
 
 		 454 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 426 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4990  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 431 aa  141  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  27.85 
 
 		 485 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  27.85 
 
 		 485 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  28.81 
 
 		 449 aa  140  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 432 aa  139  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 463 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  29.06 
 
 		 454 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 463 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  29.46 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  29.46 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  27.74 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  29.46 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  26.77 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  26.77 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  26.77 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  26.77 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  26.77 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  26.77 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  26.77 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 463 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>