More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0299 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
442 aa  888    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  46.34 
 
 
433 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  46.32 
 
 
432 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4063  major facilitator transporter  47.61 
 
 
452 aa  396  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4990  major facilitator transporter  45.22 
 
 
431 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214245  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4133  major facilitator superfamily MFS_1  44.55 
 
 
435 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4280  major facilitator superfamily MFS_1  44.11 
 
 
439 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4020  major facilitator superfamily MFS_1  44.55 
 
 
435 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8658  major facilitator superfamily MFS_1  40.96 
 
 
434 aa  329  7e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36120  putative MFS transporter  41.59 
 
 
441 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3079  MFS family transporter  42.2 
 
 
441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  33.87 
 
 
435 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  35.29 
 
 
448 aa  221  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  33.26 
 
 
456 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  32.96 
 
 
449 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  32.88 
 
 
447 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  32.88 
 
 
447 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  32.88 
 
 
447 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  32.95 
 
 
445 aa  213  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  33.73 
 
 
436 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  33.33 
 
 
446 aa  210  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  31.01 
 
 
428 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  32.71 
 
 
450 aa  209  6e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 
458 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  31.01 
 
 
428 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  31.51 
 
 
468 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0327  D-galactonate transporter  32.74 
 
 
459 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  31.01 
 
 
428 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  31.01 
 
 
428 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  32.48 
 
 
450 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  32.56 
 
 
452 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  32.79 
 
 
450 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  31.01 
 
 
428 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  32.79 
 
 
450 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  32.79 
 
 
450 aa  206  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  32.79 
 
 
450 aa  206  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  32.79 
 
 
450 aa  206  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  32.79 
 
 
450 aa  206  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  32.79 
 
 
440 aa  206  6e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  34.3 
 
 
461 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  32.56 
 
 
452 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  32.56 
 
 
452 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  32.56 
 
 
452 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  32.56 
 
 
452 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.513823 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  32.56 
 
 
450 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  30.84 
 
 
450 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  34.3 
 
 
469 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  31.81 
 
 
447 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  32.79 
 
 
450 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  33.01 
 
 
444 aa  205  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 
430 aa  205  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  33.25 
 
 
434 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  31.85 
 
 
455 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  34.21 
 
 
478 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  32.29 
 
 
464 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  32.56 
 
 
451 aa  203  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  33.33 
 
 
451 aa  203  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  31.29 
 
 
463 aa  203  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  33.25 
 
 
448 aa  202  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  31.29 
 
 
485 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  32.78 
 
 
479 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  31.71 
 
 
458 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  32.46 
 
 
455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  33.79 
 
 
436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  31.51 
 
 
485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  33.57 
 
 
463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 
442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  33.57 
 
 
463 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  33.57 
 
 
463 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  31.28 
 
 
454 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  32.08 
 
 
461 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  31.28 
 
 
454 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  31.6 
 
 
461 aa  200  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  32.71 
 
 
450 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  30.79 
 
 
458 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  32.94 
 
 
454 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  32.48 
 
 
450 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  33.25 
 
 
428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  32.7 
 
 
454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  32.7 
 
 
454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  30.81 
 
 
454 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  32.2 
 
 
438 aa  197  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  32.23 
 
 
454 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  31.72 
 
 
447 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3044  D-galactonate transporter  31.51 
 
 
464 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5322  d-galactonate transporter  31.51 
 
 
464 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0530  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 
419 aa  193  6e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.649609  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  30.81 
 
 
453 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  30.88 
 
 
444 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  30.88 
 
 
444 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  30.88 
 
 
444 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  30.88 
 
 
444 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  32.69 
 
 
448 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  32.69 
 
 
448 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  32.69 
 
 
448 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  30.88 
 
 
444 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  30.88 
 
 
444 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  32.69 
 
 
448 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  30.88 
 
 
444 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.333242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>