More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0530 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0530  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 419 aa  820    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.649609  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  29.88 
 
 		 433 aa  209  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4990  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 431 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 442 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 432 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4020  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 435 aa  196  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4133  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 435 aa  196  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4063  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36120  putative MFS transporter  30.34 
 
 		 441 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263423 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8658  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 		 434 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4280  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 439 aa  187  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3079  MFS family transporter  31.49 
 
 		 441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5549  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 450 aa  149  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 425 aa  145  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 460 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 431 aa  136  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 435 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  27.17 
 
 		 453 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 430 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 428 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 426 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 426 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 426 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 460 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 432 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 439 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 439 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  26.32 
 
 		 448 aa  126  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 419 aa  126  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  25.25 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  26.68 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  26.57 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  29.59 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  26.57 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  26.57 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  23.58 
 
 		 450 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 427 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 442 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  26.43 
 
 		 454 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  26.43 
 
 		 454 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  26.43 
 
 		 454 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 449 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  26.57 
 
 		 428 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  26.57 
 
 		 428 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 439 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 454 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  27.55 
 
 		 451 aa  123  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 422 aa  122  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 433 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.37 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  27.05 
 
 		 450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  26.81 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  26.88 
 
 		 449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  25.93 
 
 		 446 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 447 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 435 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 447 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  26.81 
 
 		 450 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  26.81 
 
 		 450 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  26.81 
 
 		 450 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 447 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  26.81 
 
 		 450 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  26.81 
 
 		 450 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  26.81 
 
 		 450 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 439 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 426 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 449 aa  119  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 446 aa  119  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  27.68 
 
 		 436 aa  119  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  26.33 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  26.81 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.28 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  22.95 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  26.72 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  28.23 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  26.33 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  27.89 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  26.72 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  29.07 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>