More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4099 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  94.69 
 
 		 433 aa  826    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  100 
 
 		 433 aa  856    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  52.98 
 
 		 455 aa  438  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  53.16 
 
 		 451 aa  441  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  51.67 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  54.84 
 
 		 429 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  54.34 
 
 		 429 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  52.3 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  52.54 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  52.3 
 
 		 433 aa  428  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  50.25 
 
 		 426 aa  423  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  48.89 
 
 		 428 aa  414  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  50.65 
 
 		 434 aa  408  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  45.87 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  49.27 
 
 		 435 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  45.75 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  44.28 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  46.06 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  47.68 
 
 		 430 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  46.88 
 
 		 423 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  46.88 
 
 		 423 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  47.54 
 
 		 430 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  46.37 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.79 
 
 		 437 aa  351  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  43.79 
 
 		 437 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.15 
 
 		 460 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3023  major facilitator transporter  47.97 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  44.61 
 
 		 439 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  43.17 
 
 		 460 aa  342  7e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  42.68 
 
 		 460 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4371  major facilitator transporter  46.34 
 
 		 368 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2672  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 433 aa  219  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 435 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 431 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 440 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 440 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 432 aa  189  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 425 aa  187  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 436 aa  183  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  30.05 
 
 		 448 aa  180  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 446 aa  180  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3474  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 415 aa  180  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00256717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 436 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 443 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  31.28 
 
 		 450 aa  173  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 436 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 436 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 436 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  29.44 
 
 		 458 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 422 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  29.21 
 
 		 458 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  29.47 
 
 		 446 aa  170  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 436 aa  170  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 426 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 426 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3397  D-galactonate transporter  30.35 
 
 		 446 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  31.51 
 
 		 445 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 449 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  29.23 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  29.23 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  29.23 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 426 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 430 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 439 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 439 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  29.23 
 
 		 446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 430 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  30.18 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  30.18 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  30.18 
 
 		 453 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 449 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  29.64 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0225  d-galactonate transporter  30.6 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305819 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0217  d-galactonate transporter  30.84 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  29.4 
 
 		 461 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  29.43 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  29.89 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  31.34 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  31.34 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  29.15 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  29.64 
 
 		 461 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  28.88 
 
 		 436 aa  161  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 479 aa  160  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  28.89 
 
 		 454 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  28.64 
 
 		 454 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  28.89 
 
 		 454 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  26.59 
 
 		 428 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>