More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3023 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  79.43 
 
 
428 aa  696    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3023  major facilitator transporter  100 
 
 
424 aa  854    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  79.9 
 
 
427 aa  687    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  58.63 
 
 
430 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  56.97 
 
 
439 aa  498  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  57.14 
 
 
426 aa  499  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  58.15 
 
 
429 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  59.56 
 
 
429 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  55.56 
 
 
428 aa  479  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  55.8 
 
 
433 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  54.46 
 
 
433 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  54.7 
 
 
433 aa  456  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  50.12 
 
 
455 aa  430  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  51.77 
 
 
435 aa  425  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  49.52 
 
 
423 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  50.24 
 
 
451 aa  424  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  49.52 
 
 
423 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  49.39 
 
 
429 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  51.69 
 
 
434 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 
433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  49.28 
 
 
430 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  49.28 
 
 
430 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  49 
 
 
425 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.97 
 
 
433 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  44.74 
 
 
430 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  43.63 
 
 
460 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.87 
 
 
460 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  45.28 
 
 
460 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.17 
 
 
437 aa  348  7e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  40.96 
 
 
437 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4371  major facilitator transporter  47.8 
 
 
368 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 
432 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  33.25 
 
 
436 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2672  major facilitator transporter  32.67 
 
 
433 aa  196  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529284  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  30.71 
 
 
428 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  30.15 
 
 
448 aa  192  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 
443 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 
442 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 
425 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  29.92 
 
 
440 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  29.92 
 
 
440 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  31.08 
 
 
446 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  31.08 
 
 
446 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  29.13 
 
 
435 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 
431 aa  186  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  32.02 
 
 
429 aa  186  7e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  28.67 
 
 
440 aa  186  9e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  30.58 
 
 
449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  28.76 
 
 
454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  27.75 
 
 
428 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  27.75 
 
 
428 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  27.75 
 
 
428 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  31.03 
 
 
450 aa  182  7e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  28.47 
 
 
458 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  30.65 
 
 
450 aa  182  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  28.47 
 
 
446 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  27.82 
 
 
428 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  30.55 
 
 
452 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  30.55 
 
 
452 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  30.55 
 
 
452 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  27.51 
 
 
428 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  30.55 
 
 
452 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.101605 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  30.55 
 
 
450 aa  180  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  30.55 
 
 
450 aa  180  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  30.55 
 
 
450 aa  180  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  30.55 
 
 
440 aa  180  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  29.91 
 
 
467 aa  180  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  30.55 
 
 
450 aa  180  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  30.55 
 
 
450 aa  180  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  30.55 
 
 
450 aa  180  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  27.85 
 
 
463 aa  180  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  28.47 
 
 
458 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  28.47 
 
 
441 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  28.47 
 
 
446 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  28.47 
 
 
446 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  29.04 
 
 
430 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  30.31 
 
 
452 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  27.99 
 
 
454 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  27.99 
 
 
454 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  29.52 
 
 
446 aa  179  9e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
422 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  30.31 
 
 
450 aa  179  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 
434 aa  179  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2955  major facilitator family transporter  27.59 
 
 
450 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  28.76 
 
 
430 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  30.31 
 
 
450 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  28.22 
 
 
446 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3034  major facilitator family transporter  27.59 
 
 
450 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.883875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3267  major facilitator family transporter  27.59 
 
 
450 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  32.15 
 
 
432 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  32.15 
 
 
432 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  32.15 
 
 
432 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3260  major facilitator family transporter  27.34 
 
 
451 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  31.11 
 
 
444 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  28.83 
 
 
432 aa  177  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  31.51 
 
 
448 aa  176  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  27.93 
 
 
453 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  31.46 
 
 
445 aa  176  9e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  31.46 
 
 
430 aa  176  9e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  31.46 
 
 
445 aa  176  9e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>