More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4371 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  97.63 
 
 		 423 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4371  major facilitator transporter  100 
 
 		 368 aa  725    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  97.63 
 
 		 423 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  88.7 
 
 		 430 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  88.12 
 
 		 430 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  89.6 
 
 		 425 aa  565  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  50.44 
 
 		 426 aa  329  4e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  52.2 
 
 		 430 aa  323  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  49.09 
 
 		 429 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  49.13 
 
 		 451 aa  318  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  48.99 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  48.7 
 
 		 433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  49.4 
 
 		 433 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  47.23 
 
 		 428 aa  311  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  50.77 
 
 		 429 aa  309  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  47.25 
 
 		 428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  48.65 
 
 		 455 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  49.7 
 
 		 429 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  46.63 
 
 		 427 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  45.43 
 
 		 433 aa  295  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  47.35 
 
 		 434 aa  294  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.34 
 
 		 433 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  46.04 
 
 		 435 aa  279  5e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  42.73 
 
 		 430 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3023  major facilitator transporter  47.8 
 
 		 424 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  41.82 
 
 		 460 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.12 
 
 		 460 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  41.34 
 
 		 460 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.03 
 
 		 437 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  43.03 
 
 		 437 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  33.23 
 
 		 425 aa  156  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 446 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 		 431 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  31.29 
 
 		 443 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 428 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 432 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 435 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 429 aa  136  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  30.3 
 
 		 448 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  29.75 
 
 		 446 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  29.75 
 
 		 458 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 430 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 422 aa  133  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 428 aa  133  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  31 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  31 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  31 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  29.43 
 
 		 458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  29.43 
 
 		 441 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  29.43 
 
 		 446 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2672  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 433 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  29.43 
 
 		 446 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  29.75 
 
 		 446 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 440 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 440 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 432 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  30.64 
 
 		 436 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 436 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 442 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 440 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 436 aa  123  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  29 
 
 		 436 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  29 
 
 		 436 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 439 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  29 
 
 		 436 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 439 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  30.25 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  30.25 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  30.25 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  30.25 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  27.55 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 439 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  29.94 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  28.93 
 
 		 445 aa  119  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 438 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 447 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 439 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6079  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 436 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  26.98 
 
 		 461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  27.49 
 
 		 461 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  27.33 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  27.16 
 
 		 436 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 447 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 429 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 428 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 430 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 428 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 430 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3474  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00256717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>