More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4070 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  87.91 
 
 
429 aa  741    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  97.21 
 
 
430 aa  813    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  100 
 
 
430 aa  855    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  96.05 
 
 
430 aa  790    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  95.58 
 
 
430 aa  788    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  95.81 
 
 
429 aa  808    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  100 
 
 
430 aa  855    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  59.24 
 
 
429 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  54.73 
 
 
433 aa  471  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  52.12 
 
 
439 aa  452  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  48.85 
 
 
424 aa  440  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
436 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  52.58 
 
 
426 aa  425  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  49.06 
 
 
431 aa  425  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  46.96 
 
 
430 aa  425  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  50.36 
 
 
441 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
454 aa  418  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  50.95 
 
 
432 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  47.81 
 
 
427 aa  415  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  49.28 
 
 
430 aa  412  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  46.39 
 
 
449 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  46.05 
 
 
453 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  44.92 
 
 
431 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  44.64 
 
 
468 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  42.53 
 
 
449 aa  338  8e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  41.33 
 
 
441 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  42.11 
 
 
457 aa  323  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  39.67 
 
 
435 aa  323  4e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  39.23 
 
 
442 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  39.53 
 
 
439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  38.48 
 
 
445 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  38.55 
 
 
441 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4265  major facilitator transporter  36.85 
 
 
489 aa  311  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762522  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  38.31 
 
 
480 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  38.52 
 
 
441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  38.31 
 
 
441 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2272  major facilitator superfamily MFS_1  39.87 
 
 
479 aa  310  4e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.972023  decreased coverage  0.00181869 
 
 
-
 
NC_003296  RS02062  putative transporter transmembrane protein  42.31 
 
 
441 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000104941  normal  0.781434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  38.19 
 
 
439 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  38.66 
 
 
442 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  39 
 
 
432 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1666  major facilitator transporter  40.24 
 
 
411 aa  293  3e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493096  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2448  major facilitator transporter  40.49 
 
 
409 aa  290  4e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  35.7 
 
 
428 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4873  major facilitator transporter  39.49 
 
 
501 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  38.9 
 
 
434 aa  265  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  34.44 
 
 
424 aa  253  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 
420 aa  247  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3658  major facilitator transporter  34.49 
 
 
432 aa  241  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  36.45 
 
 
425 aa  239  8e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  36.15 
 
 
441 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 
433 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0258  major facilitator transporter  35.03 
 
 
440 aa  232  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 
433 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  32.69 
 
 
435 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  31.2 
 
 
425 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  31.2 
 
 
425 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  34.78 
 
 
430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  31.16 
 
 
424 aa  220  3.9999999999999997e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 
430 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 
430 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  32.67 
 
 
429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  32.65 
 
 
435 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 
443 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  31.58 
 
 
433 aa  205  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  31.76 
 
 
411 aa  204  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 
432 aa  203  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  31.87 
 
 
432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0935  major facilitator transporter  31.87 
 
 
427 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.881993  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1806  major facilitator superfamily metabolite(phthalate/hexuronate)/H(+) symporter  32.68 
 
 
433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0119934 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  33.76 
 
 
428 aa  199  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  32.71 
 
 
436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  30.86 
 
 
433 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  28.16 
 
 
434 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  32.71 
 
 
436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  28.16 
 
 
434 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  28.16 
 
 
434 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  32.71 
 
 
436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  32.71 
 
 
436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  28.16 
 
 
434 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4857  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 
430 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133188  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1105  putative hexuronate MFS transporter ExuT  31.02 
 
 
434 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000998284  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0553  d-galactonate transporter  31.02 
 
 
434 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.351291  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0490  putative hexuronate MFS transporter ExuT  31.02 
 
 
433 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.40951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  31.84 
 
 
436 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  27.91 
 
 
434 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  31.53 
 
 
423 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4322  d-galactonate transporter  29.33 
 
 
432 aa  194  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3561  putative hexuronate transporter  30.53 
 
 
432 aa  193  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  30.53 
 
 
472 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02913  hypothetical protein  30.53 
 
 
472 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3529  hexuronate transporter  30.53 
 
 
432 aa  192  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 
415 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  31.66 
 
 
446 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  30.99 
 
 
449 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  31.66 
 
 
446 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3512  d-galactonate transporter  30.43 
 
 
433 aa  189  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  33.49 
 
 
440 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3386  d-galactonate transporter  29.43 
 
 
434 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3276  putative hexuronate transporter  30.53 
 
 
432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>