More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6220 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  95.88 
 
 		 437 aa  818    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 437 aa  871    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  46.01 
 
 		 426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  47.91 
 
 		 435 aa  391  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  48.17 
 
 		 429 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  47.94 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  46.49 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  46.19 
 
 		 428 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  46.89 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  45.5 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  41.63 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  45.45 
 
 		 433 aa  368  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  44.26 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  43.44 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  45.69 
 
 		 433 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  42.03 
 
 		 427 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.79 
 
 		 433 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  43.72 
 
 		 455 aa  347  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 		 451 aa  341  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  40.82 
 
 		 429 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  44.95 
 
 		 423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  44.95 
 
 		 423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 430 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 460 aa  329  8e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  43.62 
 
 		 430 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  43.37 
 
 		 425 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  43.62 
 
 		 430 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  39.26 
 
 		 460 aa  316  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.03 
 
 		 460 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3023  major facilitator transporter  40.96 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4371  major facilitator transporter  43.21 
 
 		 368 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2672  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 433 aa  186  8e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  33 
 
 		 431 aa  179  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  29.56 
 
 		 449 aa  176  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 439 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 442 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  29.98 
 
 		 436 aa  175  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  28.31 
 
 		 453 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 439 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  27.87 
 
 		 454 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 452 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 440 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 428 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 440 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 440 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 428 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 428 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 419 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  29.22 
 
 		 446 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 446 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  30.66 
 
 		 450 aa  164  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  27.91 
 
 		 463 aa  164  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  29.16 
 
 		 436 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 431 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  27.19 
 
 		 454 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  27.19 
 
 		 454 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6079  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  27.14 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 442 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  27.25 
 
 		 424 aa  160  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 453 aa  160  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  27.14 
 
 		 453 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 453 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  27.14 
 
 		 453 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 453 aa  160  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 453 aa  160  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 453 aa  160  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 449 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 432 aa  159  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  27.85 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3474  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 		 415 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00256717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  25.72 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  27.91 
 
 		 447 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  27.09 
 
 		 461 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  26.82 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4215  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 438 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.528706 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 447 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3397  D-galactonate transporter  31.57 
 
 		 446 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 426 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 426 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 426 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  28.4 
 
 		 450 aa  156  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 447 aa  156  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  27.09 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.38 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  28.2 
 
 		 429 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  27.32 
 
 		 436 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>