More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5675 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  89.45 
 
 
430 aa  739    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  89.28 
 
 
429 aa  743    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  88.01 
 
 
430 aa  740    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  100 
 
 
429 aa  852    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  87.29 
 
 
430 aa  733    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  89.45 
 
 
430 aa  740    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  88.01 
 
 
430 aa  740    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  59.16 
 
 
429 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  54.81 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  50.47 
 
 
439 aa  440  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  48.71 
 
 
436 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  47.86 
 
 
424 aa  420  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  46.1 
 
 
430 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  50.24 
 
 
427 aa  413  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  49.66 
 
 
454 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  49.76 
 
 
441 aa  408  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  47.43 
 
 
431 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  51.07 
 
 
426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  49.28 
 
 
430 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  48.94 
 
 
432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  46.23 
 
 
449 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  44.86 
 
 
453 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  44.13 
 
 
431 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  44.42 
 
 
468 aa  366  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 
449 aa  329  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  41.51 
 
 
435 aa  328  9e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  40 
 
 
445 aa  324  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  40.38 
 
 
457 aa  323  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  40.29 
 
 
441 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  40.19 
 
 
441 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  40.05 
 
 
441 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  40.05 
 
 
480 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  39.62 
 
 
442 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  39.14 
 
 
439 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  38.76 
 
 
442 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4265  major facilitator transporter  38.1 
 
 
489 aa  306  4.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  39.52 
 
 
439 aa  306  5.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  37.8 
 
 
441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2272  major facilitator superfamily MFS_1  39.23 
 
 
479 aa  299  7e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.972023  decreased coverage  0.00181869 
 
 
-
 
NC_003296  RS02062  putative transporter transmembrane protein  41.11 
 
 
441 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000104941  normal  0.781434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  37.86 
 
 
432 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2448  major facilitator transporter  39.18 
 
 
409 aa  283  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  35.31 
 
 
428 aa  279  6e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1666  major facilitator transporter  38.07 
 
 
411 aa  277  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493096  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4873  major facilitator transporter  39.31 
 
 
501 aa  275  9e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  37.41 
 
 
434 aa  260  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  37.32 
 
 
420 aa  249  7e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  34.86 
 
 
425 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  31.98 
 
 
424 aa  240  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  35.58 
 
 
441 aa  237  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 
433 aa  235  9e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 
433 aa  235  9e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0258  major facilitator transporter  35.27 
 
 
440 aa  233  4.0000000000000004e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3658  major facilitator transporter  33.18 
 
 
432 aa  230  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  33.97 
 
 
435 aa  223  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  31.75 
 
 
424 aa  219  6e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  34.1 
 
 
430 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 
430 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  31.27 
 
 
425 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 
430 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  31.27 
 
 
425 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  32.01 
 
 
432 aa  209  8e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  32.16 
 
 
435 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 
443 aa  208  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  31.15 
 
 
411 aa  205  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  30.88 
 
 
433 aa  204  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  32.14 
 
 
428 aa  203  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  31.09 
 
 
429 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0490  putative hexuronate MFS transporter ExuT  30.17 
 
 
433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.40951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1105  putative hexuronate MFS transporter ExuT  30.09 
 
 
434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000998284  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0553  d-galactonate transporter  30.09 
 
 
434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.351291  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3561  putative hexuronate transporter  31.28 
 
 
432 aa  200  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  31.28 
 
 
472 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  31.5 
 
 
436 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02913  hypothetical protein  31.28 
 
 
472 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  31.5 
 
 
436 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  31.5 
 
 
436 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  31.85 
 
 
436 aa  199  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3529  hexuronate transporter  31.28 
 
 
432 aa  199  7e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  31.87 
 
 
432 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  30.17 
 
 
433 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  31.5 
 
 
436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  29.59 
 
 
434 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  29.59 
 
 
434 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  30.1 
 
 
423 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  29.59 
 
 
434 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  29.59 
 
 
434 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  29.59 
 
 
434 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0935  major facilitator transporter  32.32 
 
 
427 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.881993  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 
415 aa  193  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1806  major facilitator superfamily metabolite(phthalate/hexuronate)/H(+) symporter  31.78 
 
 
433 aa  193  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0119934 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4408  hexuronate transporter  31.28 
 
 
432 aa  192  9e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.591703 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0608  d-galactonate transporter  31.28 
 
 
432 aa  192  9e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3276  putative hexuronate transporter  31.28 
 
 
432 aa  192  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0607  d-galactonate transporter  31.28 
 
 
432 aa  192  9e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3385  hexuronate transporter  31.28 
 
 
432 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4322  d-galactonate transporter  28.98 
 
 
432 aa  191  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4857  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 
430 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133188  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  29.89 
 
 
446 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  30.36 
 
 
449 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>