More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5808 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4371  major facilitator transporter  97.63 
 
 
368 aa  647    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  91.75 
 
 
425 aa  736    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  90.47 
 
 
430 aa  738    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  100 
 
 
423 aa  836    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  90.93 
 
 
430 aa  745    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  100 
 
 
423 aa  836    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  52.17 
 
 
426 aa  428  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  53.43 
 
 
433 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  52.97 
 
 
433 aa  415  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  52.73 
 
 
433 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  51.21 
 
 
429 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  50.59 
 
 
430 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  47.74 
 
 
428 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  48.1 
 
 
428 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  51.72 
 
 
429 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  49.64 
 
 
451 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  49.38 
 
 
429 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  47.99 
 
 
427 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  49.63 
 
 
455 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  47.75 
 
 
435 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  48.31 
 
 
434 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  46.5 
 
 
433 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  44.82 
 
 
439 aa  359  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3023  major facilitator transporter  49.52 
 
 
424 aa  358  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  43.51 
 
 
430 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.88 
 
 
433 aa  352  8e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.58 
 
 
437 aa  335  9e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  44.82 
 
 
437 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  42.51 
 
 
460 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  42.13 
 
 
460 aa  328  7e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43 
 
 
460 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 
425 aa  193  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 
443 aa  192  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 
432 aa  189  8e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  31.39 
 
 
446 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  32.61 
 
 
428 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  31.31 
 
 
448 aa  186  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  33.68 
 
 
439 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  33.68 
 
 
439 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  31.68 
 
 
435 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 
431 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  33.42 
 
 
439 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  32.69 
 
 
440 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  31.16 
 
 
428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  32.45 
 
 
426 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  32.45 
 
 
426 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  32.45 
 
 
426 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  32.9 
 
 
439 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2672  major facilitator transporter  32.69 
 
 
433 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529284  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  30.82 
 
 
436 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  31.38 
 
 
436 aa  176  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  30.25 
 
 
436 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  30.25 
 
 
436 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  30.25 
 
 
436 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  30.71 
 
 
446 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  29.93 
 
 
458 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  33.42 
 
 
439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 
419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  30.71 
 
 
458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  30.71 
 
 
441 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  30.71 
 
 
446 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  30.71 
 
 
446 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  33.42 
 
 
439 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  32.13 
 
 
436 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  30.92 
 
 
440 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  30.28 
 
 
430 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  30.92 
 
 
440 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  30.66 
 
 
427 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  31.22 
 
 
436 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  30.73 
 
 
430 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  31.27 
 
 
428 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  31.27 
 
 
428 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  31.27 
 
 
428 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  30.71 
 
 
446 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  30.77 
 
 
432 aa  169  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  31.02 
 
 
428 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  31.02 
 
 
428 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  29.67 
 
 
432 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  29.67 
 
 
432 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  29.67 
 
 
432 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  30.37 
 
 
430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  30.37 
 
 
430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  30.86 
 
 
430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  30.37 
 
 
445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  30.37 
 
 
445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  30.37 
 
 
430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  30.37 
 
 
430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  30.37 
 
 
430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  28.54 
 
 
461 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  28.79 
 
 
429 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  28.16 
 
 
438 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 
439 aa  166  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  28.76 
 
 
461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  29.64 
 
 
445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  30.68 
 
 
447 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  30.68 
 
 
447 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  30.68 
 
 
447 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  30.15 
 
 
429 aa  163  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  28.5 
 
 
447 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  28.16 
 
 
436 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>