More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4501 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  100 
 
 
427 aa  858    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  58.13 
 
 
449 aa  491  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  58 
 
 
449 aa  491  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  56.49 
 
 
452 aa  484  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  56.07 
 
 
453 aa  481  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  55.84 
 
 
453 aa  480  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  55.84 
 
 
453 aa  480  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  55.84 
 
 
453 aa  479  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  56.07 
 
 
453 aa  481  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  55.84 
 
 
453 aa  480  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  56.07 
 
 
453 aa  481  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  56.07 
 
 
453 aa  481  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  40.81 
 
 
436 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  43.07 
 
 
447 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  41.15 
 
 
438 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  40.76 
 
 
436 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  42.82 
 
 
447 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  41.23 
 
 
436 aa  333  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  42.37 
 
 
447 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  43.33 
 
 
440 aa  332  9e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  43.24 
 
 
450 aa  326  5e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  42 
 
 
439 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  41.77 
 
 
439 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  41.77 
 
 
439 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  41.41 
 
 
439 aa  319  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  42.93 
 
 
439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  42.48 
 
 
439 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  42.13 
 
 
437 aa  309  8e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  42.72 
 
 
439 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  38.88 
 
 
432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  39.71 
 
 
431 aa  283  5.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  36.21 
 
 
431 aa  271  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  34.71 
 
 
436 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  36.8 
 
 
428 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  36.74 
 
 
425 aa  229  8e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  33.98 
 
 
436 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  33.98 
 
 
436 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  33.98 
 
 
436 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  33.98 
 
 
436 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 
442 aa  226  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  33.49 
 
 
435 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2845  major facilitator transporter  31.48 
 
 
449 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.498164 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  31.69 
 
 
454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  31.69 
 
 
454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  31.69 
 
 
454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 
443 aa  216  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  33.25 
 
 
436 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2344  major facilitator transporter  32.15 
 
 
449 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  33.96 
 
 
448 aa  216  9e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  32.65 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  32.65 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  32.65 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  32.65 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  32.65 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  32.65 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  32.65 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  32.72 
 
 
444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  32.07 
 
 
444 aa  213  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  32.34 
 
 
434 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  31.21 
 
 
454 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  31.84 
 
 
436 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  33.49 
 
 
448 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  31.88 
 
 
432 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  31.88 
 
 
432 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  31.88 
 
 
432 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  33.73 
 
 
478 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  34.38 
 
 
436 aa  209  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 
419 aa  210  5e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  32.33 
 
 
446 aa  209  7e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.97 
 
 
456 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  32.16 
 
 
466 aa  209  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  31.42 
 
 
430 aa  208  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  31.42 
 
 
430 aa  208  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  31.74 
 
 
410 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.980065 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  31.42 
 
 
430 aa  207  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  31.42 
 
 
430 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  31.42 
 
 
430 aa  207  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  31.42 
 
 
445 aa  207  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  31.42 
 
 
445 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  31.42 
 
 
430 aa  206  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  31.07 
 
 
446 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  30.5 
 
 
467 aa  206  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  33.41 
 
 
447 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  33.41 
 
 
447 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  33.18 
 
 
447 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  33.41 
 
 
449 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  31.07 
 
 
446 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  33.49 
 
 
444 aa  205  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  32.39 
 
 
469 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  32.71 
 
 
450 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  32.63 
 
 
479 aa  203  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  32.31 
 
 
463 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  32.31 
 
 
463 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  32.39 
 
 
461 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  32.16 
 
 
464 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  32.31 
 
 
463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  30.5 
 
 
455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  32.56 
 
 
455 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2392  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 
416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  29.79 
 
 
449 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>