More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2210 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  100 
 
 
455 aa  913    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  66.51 
 
 
451 aa  604  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  56.48 
 
 
433 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  55.07 
 
 
429 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  56.72 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  56.72 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  54.16 
 
 
433 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  54.24 
 
 
429 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  51.36 
 
 
426 aa  448  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  51.82 
 
 
430 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  53.72 
 
 
433 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  51.33 
 
 
428 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  49.29 
 
 
427 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  50.38 
 
 
434 aa  428  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  48.4 
 
 
428 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  45.43 
 
 
429 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  51.56 
 
 
435 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  47.57 
 
 
430 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  49.63 
 
 
423 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  49.63 
 
 
423 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  49.41 
 
 
430 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  50.75 
 
 
430 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3023  major facilitator transporter  50.24 
 
 
424 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  49.63 
 
 
425 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  43.19 
 
 
439 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.26 
 
 
460 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 
460 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  43.34 
 
 
460 aa  352  8e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.09 
 
 
437 aa  350  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  43.09 
 
 
437 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4371  major facilitator transporter  48.65 
 
 
368 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  34.1 
 
 
443 aa  219  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2672  major facilitator transporter  34.16 
 
 
433 aa  209  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529284  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 
432 aa  204  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  30.71 
 
 
428 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  30.95 
 
 
428 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  30.95 
 
 
428 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  30.95 
 
 
428 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  30.71 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  31.19 
 
 
429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  30.79 
 
 
428 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  28.51 
 
 
458 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  28.51 
 
 
446 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  33.25 
 
 
436 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  30.53 
 
 
440 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  30.53 
 
 
440 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  28.51 
 
 
458 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  29.63 
 
 
435 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 
442 aa  190  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  29.43 
 
 
432 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  28.51 
 
 
441 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  28.51 
 
 
446 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  28.51 
 
 
446 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  28.31 
 
 
446 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  32.02 
 
 
436 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  32.58 
 
 
436 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  32.58 
 
 
436 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  32.58 
 
 
436 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  31.74 
 
 
450 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  31.74 
 
 
450 aa  187  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  31.74 
 
 
450 aa  187  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  31.74 
 
 
450 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  31.74 
 
 
450 aa  187  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  31.74 
 
 
450 aa  187  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  31.74 
 
 
450 aa  187  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  30.93 
 
 
428 aa  187  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  31.85 
 
 
436 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  31.51 
 
 
450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  32.38 
 
 
448 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 
425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3474  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 
415 aa  184  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00256717  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  29.9 
 
 
430 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 
442 aa  183  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  30.69 
 
 
426 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  30.43 
 
 
426 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  30.43 
 
 
426 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  32.38 
 
 
440 aa  182  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  31.75 
 
 
452 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  31.1 
 
 
451 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  29.9 
 
 
430 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 
431 aa  180  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  31.75 
 
 
452 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  31.75 
 
 
452 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  31.75 
 
 
452 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  31.75 
 
 
452 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  31.01 
 
 
450 aa  180  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  31.78 
 
 
431 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  30.29 
 
 
450 aa  178  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  33.92 
 
 
419 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  28.72 
 
 
446 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  30.75 
 
 
453 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  30.1 
 
 
454 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  31.01 
 
 
463 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  30.1 
 
 
454 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4063  major facilitator transporter  32.83 
 
 
452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  30.1 
 
 
446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  30.02 
 
 
454 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  29.85 
 
 
446 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  31.41 
 
 
434 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  29.75 
 
 
445 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>