More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3525 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  100 
 
 		 428 aa  858    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  71.76 
 
 		 426 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  61.68 
 
 		 430 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  64.58 
 
 		 429 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  63.97 
 
 		 429 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  60.33 
 
 		 433 aa  508  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  60.57 
 
 		 433 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  60.57 
 
 		 433 aa  504  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  53.69 
 
 		 428 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  53.66 
 
 		 429 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  54.69 
 
 		 434 aa  453  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  53.49 
 
 		 435 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  53.81 
 
 		 427 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  51.46 
 
 		 455 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  51.09 
 
 		 439 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  49.52 
 
 		 451 aa  417  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  48.64 
 
 		 433 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3023  major facilitator transporter  55.56 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  48.89 
 
 		 433 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  45.2 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  48.1 
 
 		 423 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  48.1 
 
 		 423 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.91 
 
 		 460 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  44.95 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  47.04 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  48.78 
 
 		 425 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  44.95 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  47.04 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.7 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  46.19 
 
 		 437 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4371  major facilitator transporter  47.23 
 
 		 368 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 432 aa  209  9e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2672  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 433 aa  206  6e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  31.73 
 
 		 448 aa  189  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  29.88 
 
 		 450 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 431 aa  186  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 428 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  28.89 
 
 		 450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 		 442 aa  184  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 425 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  29.05 
 
 		 454 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  29.05 
 
 		 454 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  28.96 
 
 		 454 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  28.34 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 442 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  30.96 
 
 		 463 aa  179  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 449 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 440 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 440 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 447 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 447 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  27.65 
 
 		 452 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  28.64 
 
 		 451 aa  177  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  27.79 
 
 		 461 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  28.4 
 
 		 452 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 432 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  28.4 
 
 		 452 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  28.4 
 
 		 452 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  28.4 
 
 		 452 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  30.07 
 
 		 449 aa  176  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  31.12 
 
 		 448 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  31.12 
 
 		 448 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  31.12 
 
 		 448 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  31.12 
 
 		 448 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  31.12 
 
 		 448 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  31.12 
 
 		 448 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  31.12 
 
 		 448 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  28.01 
 
 		 461 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  27.9 
 
 		 440 aa  175  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  27.9 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  27.9 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  27.9 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  27.9 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  27.9 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  27.9 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  27.9 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  31.4 
 
 		 436 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 422 aa  173  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 446 aa  173  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  28.99 
 
 		 446 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  27.9 
 
 		 450 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 446 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2955  major facilitator family transporter  28.86 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  28.02 
 
 		 468 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 455 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3260  major facilitator family transporter  28.61 
 
 		 451 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 443 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3034  major facilitator family transporter  28.61 
 
 		 450 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.883875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3267  major facilitator family transporter  28.61 
 
 		 450 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0841  d-galactonate transporter  29.63 
 
 		 450 aa  170  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  29.72 
 
 		 450 aa  170  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  26.73 
 
 		 428 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  26.49 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  26.49 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  28.92 
 
 		 424 aa  167  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  26.49 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>