More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2915 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  100 
 
 		 430 aa  853    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  77.29 
 
 		 429 aa  630  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  76.21 
 
 		 429 aa  621  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  68.13 
 
 		 426 aa  569  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  67.37 
 
 		 433 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  67.6 
 
 		 433 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  66.9 
 
 		 433 aa  560  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  61.68 
 
 		 428 aa  538  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  57.31 
 
 		 428 aa  501  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  59.07 
 
 		 434 aa  495  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  56.28 
 
 		 427 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  58.88 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  55.69 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3023  major facilitator transporter  58.63 
 
 		 424 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  52.22 
 
 		 455 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  51.91 
 
 		 451 aa  438  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  51.44 
 
 		 433 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  51.67 
 
 		 433 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  51.1 
 
 		 439 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  50.59 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  50.59 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  51.43 
 
 		 430 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  51.19 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  50.72 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  45.71 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.49 
 
 		 437 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  46.49 
 
 		 437 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 460 aa  352  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.25 
 
 		 460 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  43.5 
 
 		 460 aa  341  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4371  major facilitator transporter  52.2 
 
 		 368 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  33.74 
 
 		 431 aa  209  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 		 422 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 432 aa  206  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 440 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 440 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2672  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 		 442 aa  190  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 440 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 443 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 425 aa  187  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 435 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 442 aa  186  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3474  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 		 415 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00256717  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  31.51 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  29.86 
 
 		 463 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  29.89 
 
 		 453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  30.55 
 
 		 419 aa  183  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 436 aa  182  7e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  29.37 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  29.37 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.46 
 
 		 456 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  29.75 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  30.1 
 
 		 461 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  30.34 
 
 		 461 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  28.18 
 
 		 440 aa  178  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0963  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 454 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2955  major facilitator family transporter  29.19 
 
 		 450 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  28.18 
 
 		 450 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3260  major facilitator family transporter  29.19 
 
 		 451 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3034  major facilitator family transporter  28.83 
 
 		 450 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.883875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3267  major facilitator family transporter  28.83 
 
 		 450 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  27.79 
 
 		 452 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  27.95 
 
 		 450 aa  176  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  27.95 
 
 		 450 aa  176  8e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  27.95 
 
 		 450 aa  176  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  27.95 
 
 		 450 aa  176  8e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  27.95 
 
 		 450 aa  176  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  27.95 
 
 		 450 aa  176  8e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  27.87 
 
 		 450 aa  176  9e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  27.79 
 
 		 452 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  27.79 
 
 		 452 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  27.79 
 
 		 452 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  27.79 
 
 		 452 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  29.17 
 
 		 468 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  27.5 
 
 		 451 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 429 aa  174  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  28.97 
 
 		 424 aa  173  5e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 447 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 447 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 447 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 446 aa  172  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  28.43 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  28.43 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  28.43 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  28.43 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  29.02 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 458 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  29.02 
 
 		 458 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  29.02 
 
 		 441 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  30.23 
 
 		 449 aa  170  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  27.56 
 
 		 450 aa  170  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  28.19 
 
 		 428 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  29.02 
 
 		 458 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>