More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2069 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  100 
 
 		 424 aa  852    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2587  major facilitator transporter  83.85 
 
 		 425 aa  733    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2535  major facilitator transporter  83.85 
 
 		 425 aa  733    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  43.46 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  31.97 
 
 		 448 aa  202  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2672  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 433 aa  195  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6079  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 413 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  28.8 
 
 		 468 aa  190  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 442 aa  189  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  32.64 
 
 		 446 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  32.16 
 
 		 428 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  32.16 
 
 		 428 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0963  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  32.13 
 
 		 449 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 446 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  30.17 
 
 		 453 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  29 
 
 		 461 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 467 aa  186  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  29 
 
 		 461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3474  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00256717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 453 aa  180  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4215  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.528706 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 435 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 428 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  28.61 
 
 		 450 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 430 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  32.84 
 
 		 433 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 430 aa  173  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  27.31 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  28.4 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  27.38 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  27.38 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  27.38 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  27.38 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  27.38 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  27.38 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  27.38 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0225  d-galactonate transporter  28.94 
 
 		 446 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305819 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0217  d-galactonate transporter  28.54 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 434 aa  170  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  27.68 
 
 		 463 aa  170  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  30 
 
 		 445 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  28.18 
 
 		 454 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  28.18 
 
 		 454 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 		 442 aa  169  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  28.4 
 
 		 450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  27.93 
 
 		 454 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4020  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 435 aa  167  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 440 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 440 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4133  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 435 aa  167  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 439 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.65 
 
 		 456 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  29.24 
 
 		 458 aa  166  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 432 aa  166  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  26.6 
 
 		 458 aa  166  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  28.88 
 
 		 434 aa  166  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  27.91 
 
 		 444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3397  D-galactonate transporter  27.83 
 
 		 446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  29.15 
 
 		 448 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  27.07 
 
 		 453 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 439 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  30.75 
 
 		 451 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6462  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.320121  hitchhiker  0.0000481514 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0327  D-galactonate transporter  28.99 
 
 		 459 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0807  d-galactonate transporter  27.31 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 460 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  28.37 
 
 		 485 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 435 aa  162  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0187  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.53 
 
 		 451 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4735  galactarate transporter  28.11 
 
 		 453 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388057  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  27.48 
 
 		 451 aa  160  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3044  D-galactonate transporter  28.4 
 
 		 464 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  28.37 
 
 		 485 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  27.46 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5322  d-galactonate transporter  28.4 
 
 		 464 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  29.27 
 
 		 436 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0202  d-galactonate transporter  28.47 
 
 		 446 aa  160  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317635  unclonable  0.00000000000905697 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  27.53 
 
 		 450 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  27.53 
 
 		 450 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 434 aa  159  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3916  probable glucarate transporter  29.55 
 
 		 436 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4023  glucarate transporter  29.55 
 
 		 436 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.957782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4084  probable glucarate transporter  29.55 
 
 		 436 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.463281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3978  putative glucarate transporter  29.55 
 
 		 436 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.776069 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 437 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>