More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5368 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  100 
 
 
432 aa  848    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  90.02 
 
 
440 aa  717    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  89.58 
 
 
428 aa  737    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  90.02 
 
 
440 aa  717    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  48.47 
 
 
431 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  49.54 
 
 
430 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  46.12 
 
 
426 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  46.12 
 
 
426 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  46.35 
 
 
426 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  41.63 
 
 
428 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  41.63 
 
 
428 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  41.63 
 
 
428 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  41.63 
 
 
428 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  41.39 
 
 
428 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  42.76 
 
 
446 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  42.76 
 
 
458 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  43.12 
 
 
429 aa  344  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  42.52 
 
 
458 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  42.52 
 
 
446 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  42.52 
 
 
446 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  43.03 
 
 
441 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  46.78 
 
 
430 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  46.88 
 
 
430 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  44.1 
 
 
446 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  37.41 
 
 
422 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 
442 aa  243  5e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 
425 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3260  major facilitator family transporter  31.03 
 
 
451 aa  226  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2955  major facilitator family transporter  31.03 
 
 
450 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  32.25 
 
 
435 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  33.49 
 
 
447 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  33.49 
 
 
447 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  33.49 
 
 
447 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  35.31 
 
 
444 aa  223  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3034  major facilitator family transporter  30.54 
 
 
450 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.883875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3267  major facilitator family transporter  30.54 
 
 
450 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  34.05 
 
 
449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  34.6 
 
 
448 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  33.65 
 
 
446 aa  219  7.999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  33.41 
 
 
450 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  34.29 
 
 
448 aa  219  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  34.3 
 
 
446 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  34.3 
 
 
446 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  34.22 
 
 
449 aa  217  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  33.1 
 
 
455 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  33.1 
 
 
456 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  35.73 
 
 
448 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  35.73 
 
 
448 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  35.73 
 
 
448 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  35.73 
 
 
448 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  35.73 
 
 
448 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  35.73 
 
 
448 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  35.73 
 
 
448 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  32.34 
 
 
430 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0068  major facilitator transporter  31.2 
 
 
447 aa  212  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274354  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  31.72 
 
 
440 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  32.35 
 
 
450 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  34.22 
 
 
469 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  34.87 
 
 
443 aa  207  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 
442 aa  207  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  32.72 
 
 
445 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  32.7 
 
 
434 aa  206  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  34.64 
 
 
463 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  34.64 
 
 
463 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1889  major facilitator family transporter  31.03 
 
 
435 aa  205  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000253585  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1963  major facilitator family transporter  31.42 
 
 
435 aa  205  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000192177  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  32.04 
 
 
436 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  34.61 
 
 
467 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  32.77 
 
 
436 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  34.22 
 
 
461 aa  205  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 
432 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  34.4 
 
 
463 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  30.18 
 
 
454 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  30.05 
 
 
454 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  33.49 
 
 
479 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  30.05 
 
 
454 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  33.26 
 
 
436 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  32.53 
 
 
451 aa  203  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  32.35 
 
 
450 aa  203  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  30.18 
 
 
453 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  33.73 
 
 
464 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  32.94 
 
 
458 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 
460 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  33.25 
 
 
436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  33.25 
 
 
436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  33.25 
 
 
436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  33.25 
 
 
436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2344  major facilitator transporter  32.52 
 
 
449 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  33.01 
 
 
428 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  33.01 
 
 
428 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 
429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  32.36 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.04 
 
 
460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4215  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 
438 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.528706 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  30.12 
 
 
444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  30.12 
 
 
444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  30.12 
 
 
444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  33.68 
 
 
429 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  30.12 
 
 
444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  30.12 
 
 
444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>