More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4254 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  84.36 
 
 		 427 aa  739    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  100 
 
 		 428 aa  867    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3023  major facilitator transporter  79.43 
 
 		 424 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  57.31 
 
 		 430 aa  501  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  56.52 
 
 		 439 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  57.87 
 
 		 426 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  59.02 
 
 		 429 aa  488  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  58.13 
 
 		 429 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  55.24 
 
 		 433 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  56.09 
 
 		 433 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  55.48 
 
 		 433 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  53.69 
 
 		 428 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  52.94 
 
 		 434 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  50.94 
 
 		 435 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  49.01 
 
 		 429 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  48.99 
 
 		 455 aa  414  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  46.46 
 
 		 451 aa  405  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  47.74 
 
 		 423 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  47.74 
 
 		 423 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  45.06 
 
 		 430 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  46.96 
 
 		 430 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  46.84 
 
 		 430 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  45.3 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  47.75 
 
 		 425 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.87 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.56 
 
 		 437 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  46.44 
 
 		 460 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  41.63 
 
 		 437 aa  360  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  43.09 
 
 		 460 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.32 
 
 		 460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4371  major facilitator transporter  47.25 
 
 		 368 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 432 aa  201  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3034  major facilitator family transporter  30.92 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.883875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2955  major facilitator family transporter  30.92 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3267  major facilitator family transporter  30.92 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3260  major facilitator family transporter  30.67 
 
 		 451 aa  193  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  28.4 
 
 		 428 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  28.4 
 
 		 428 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  28.4 
 
 		 428 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 		 442 aa  189  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  28.4 
 
 		 428 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  29.2 
 
 		 448 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  28.47 
 
 		 428 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 431 aa  186  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 419 aa  184  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2672  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 433 aa  182  9.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 440 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 440 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 430 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 430 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 432 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 426 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 426 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  29.11 
 
 		 463 aa  177  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  30.69 
 
 		 429 aa  176  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 443 aa  176  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 440 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  28.19 
 
 		 454 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  27.9 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0068  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 447 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  27.9 
 
 		 458 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  30 
 
 		 426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  28.04 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  27.63 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  27.63 
 
 		 446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  28.04 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  27.63 
 
 		 446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  27.63 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  27.03 
 
 		 461 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 467 aa  173  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 429 aa  173  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  29.72 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  26.98 
 
 		 446 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2587  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 425 aa  171  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2535  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 425 aa  171  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  27.94 
 
 		 453 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 434 aa  170  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  29.26 
 
 		 450 aa  170  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 436 aa  170  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  28.15 
 
 		 424 aa  169  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  26.81 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  28.14 
 
 		 449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  29.72 
 
 		 440 aa  166  9e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  29.72 
 
 		 450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  29.72 
 
 		 450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  30.43 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  29.72 
 
 		 450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  29.8 
 
 		 430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  29.72 
 
 		 450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  29.72 
 
 		 450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  29.72 
 
 		 450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  30.43 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  30.43 
 
 		 432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  29.72 
 
 		 450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  29.48 
 
 		 450 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 430 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 431 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  29.48 
 
 		 452 aa  163  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>