More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3053 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  90 
 
 
430 aa  735    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  100 
 
 
425 aa  842    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  93.88 
 
 
423 aa  790    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  89.77 
 
 
430 aa  740    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  93.88 
 
 
423 aa  790    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4371  major facilitator transporter  92.65 
 
 
368 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  51.4 
 
 
426 aa  427  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  53.66 
 
 
433 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  53.41 
 
 
433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  53.07 
 
 
433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  50 
 
 
430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  51.45 
 
 
429 aa  405  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  48.36 
 
 
428 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  51.09 
 
 
429 aa  398  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  48.51 
 
 
428 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  49.63 
 
 
429 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  49.04 
 
 
451 aa  386  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  46.89 
 
 
427 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  50.37 
 
 
455 aa  385  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  47.67 
 
 
434 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  47.29 
 
 
435 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  46.36 
 
 
433 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  44.87 
 
 
439 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  43.75 
 
 
430 aa  362  6e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3023  major facilitator transporter  49.76 
 
 
424 aa  355  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.12 
 
 
433 aa  349  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  43.75 
 
 
460 aa  335  9e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.23 
 
 
460 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  43.13 
 
 
460 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.61 
 
 
437 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  43.86 
 
 
437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 
425 aa  190  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  31.73 
 
 
435 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  32.57 
 
 
443 aa  189  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 
432 aa  189  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  33.07 
 
 
439 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  33.07 
 
 
439 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 
431 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  30.84 
 
 
448 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  32.82 
 
 
439 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  29.71 
 
 
446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  30.9 
 
 
428 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  32.56 
 
 
439 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  31.87 
 
 
440 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  30.75 
 
 
436 aa  179  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  30.94 
 
 
428 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  31.96 
 
 
426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  31.09 
 
 
436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  31.96 
 
 
426 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  31.96 
 
 
426 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  32.56 
 
 
439 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  30.12 
 
 
436 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  32.56 
 
 
439 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  30.24 
 
 
427 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  29.08 
 
 
458 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  29.83 
 
 
446 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  29.6 
 
 
436 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  29.6 
 
 
436 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  29.6 
 
 
436 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  30.42 
 
 
440 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  30.42 
 
 
440 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  29.83 
 
 
441 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  29.83 
 
 
458 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  29.34 
 
 
432 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  29.34 
 
 
432 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  29.34 
 
 
432 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  29.83 
 
 
446 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  29.83 
 
 
446 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  31.91 
 
 
428 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  31.91 
 
 
428 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2672  major facilitator transporter  32.23 
 
 
433 aa  169  9e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529284  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  31.91 
 
 
428 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  30.88 
 
 
436 aa  169  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  29.67 
 
 
430 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  29.67 
 
 
430 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  30.18 
 
 
430 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  28.44 
 
 
461 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  28.9 
 
 
429 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  29.67 
 
 
445 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  29.67 
 
 
445 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  30.17 
 
 
430 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  29.67 
 
 
430 aa  169  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  29.67 
 
 
430 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  29.67 
 
 
430 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  28.67 
 
 
461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 
419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 
439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  29.84 
 
 
430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  31.66 
 
 
428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  31.66 
 
 
428 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  29.85 
 
 
446 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  29.78 
 
 
432 aa  166  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  28.4 
 
 
438 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  30.75 
 
 
447 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  30.75 
 
 
447 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  29.31 
 
 
445 aa  163  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  30.75 
 
 
447 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  28.4 
 
 
410 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  29.55 
 
 
467 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0010  d-galactonate transporter  28.39 
 
 
430 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.661181  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>