More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0703 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  76.13 
 
 		 430 aa  667    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  100 
 
 		 460 aa  919    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  87.83 
 
 		 460 aa  837    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  96.74 
 
 		 460 aa  901    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  47.6 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  49.37 
 
 		 433 aa  391  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  50.38 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  45.91 
 
 		 428 aa  388  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  49.62 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  47.45 
 
 		 434 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  48.84 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  43.97 
 
 		 427 aa  360  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  44.26 
 
 		 455 aa  359  5e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  43.32 
 
 		 428 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  45.37 
 
 		 433 aa  352  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  45.99 
 
 		 451 aa  348  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  44.25 
 
 		 430 aa  343  4e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.15 
 
 		 433 aa  336  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 439 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  43 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  43 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  43.2 
 
 		 425 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 430 aa  315  7e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 430 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3023  major facilitator transporter  44.71 
 
 		 424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 		 437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.8 
 
 		 437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4371  major facilitator transporter  42.12 
 
 		 368 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2672  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 433 aa  233  8.000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  29.88 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  29.65 
 
 		 428 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  29.65 
 
 		 428 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  29.65 
 
 		 428 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  29.41 
 
 		 428 aa  223  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 429 aa  209  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 428 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 432 aa  207  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 440 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 440 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  33.65 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  31.57 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  34.73 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  31.48 
 
 		 448 aa  199  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  30.54 
 
 		 463 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 436 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 436 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 436 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  32.02 
 
 		 453 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 431 aa  194  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 		 442 aa  192  9e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  31.53 
 
 		 454 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  31.53 
 
 		 454 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 432 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  31.77 
 
 		 454 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  31.45 
 
 		 468 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 430 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 446 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3474  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 		 415 aa  189  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00256717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  31.57 
 
 		 426 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  31.57 
 
 		 426 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  31.08 
 
 		 446 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  31.08 
 
 		 461 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 428 aa  187  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  30.12 
 
 		 461 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  34 
 
 		 451 aa  187  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  29.97 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  31.44 
 
 		 436 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  30.75 
 
 		 458 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 426 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  31.34 
 
 		 449 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 469 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 463 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 463 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4063  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  30.14 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  30.14 
 
 		 450 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  28.3 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 463 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  28.3 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  31.87 
 
 		 444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  31.15 
 
 		 444 aa  180  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  31.15 
 
 		 444 aa  180  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  31.15 
 
 		 444 aa  180  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  31.15 
 
 		 444 aa  180  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  31.15 
 
 		 444 aa  180  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>