More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0963 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0963  major facilitator transporter  100 
 
 		 454 aa  894    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  30.81 
 
 		 424 aa  213  5.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 435 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2535  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2587  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  33.48 
 
 		 448 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  30.73 
 
 		 445 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  29.23 
 
 		 461 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  29.79 
 
 		 468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  29.23 
 
 		 461 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  30 
 
 		 453 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 430 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 467 aa  187  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  30.16 
 
 		 450 aa  186  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  29.16 
 
 		 450 aa  186  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  28.93 
 
 		 450 aa  186  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  31.05 
 
 		 449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  28.27 
 
 		 454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 		 453 aa  183  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  28.11 
 
 		 454 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  28.11 
 
 		 454 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  30.12 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  31.62 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.95 
 
 		 456 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  28.54 
 
 		 453 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  30.63 
 
 		 450 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  30.63 
 
 		 450 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  28.05 
 
 		 451 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  29.21 
 
 		 463 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0217  d-galactonate transporter  31.54 
 
 		 446 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0225  d-galactonate transporter  31.54 
 
 		 446 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305819 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  28.15 
 
 		 440 aa  176  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4735  galactarate transporter  28.57 
 
 		 453 aa  176  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388057  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  28.26 
 
 		 452 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  27.92 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  27.92 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  27.92 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  28.26 
 
 		 452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  28.26 
 
 		 452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  28.26 
 
 		 452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  27.92 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0187  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  30.63 
 
 		 451 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  27.92 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  28.26 
 
 		 452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  27.92 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  27.92 
 
 		 450 aa  173  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0841  d-galactonate transporter  29.38 
 
 		 450 aa  173  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  30.35 
 
 		 450 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  27.69 
 
 		 450 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0807  d-galactonate transporter  28.38 
 
 		 450 aa  172  7.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  29.57 
 
 		 448 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 432 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  27.75 
 
 		 458 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 442 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 444 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  30.72 
 
 		 450 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3397  D-galactonate transporter  31.54 
 
 		 446 aa  170  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 440 aa  170  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0277  d-galactonate transporter  29.72 
 
 		 446 aa  170  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370556 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 440 aa  170  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 458 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0202  d-galactonate transporter  31.62 
 
 		 446 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317635  unclonable  0.00000000000905697 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  29 
 
 		 444 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  30.02 
 
 		 447 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2810  D-galactonate transporter  31.15 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  29.91 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0296  d-galactonate transporter  31.15 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106935  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  29.91 
 
 		 454 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  29.91 
 
 		 454 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 450 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  29.91 
 
 		 454 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  31.27 
 
 		 436 aa  167  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 443 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 428 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 428 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 455 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 436 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 430 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2344  major facilitator transporter  29.54 
 
 		 449 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 432 aa  163  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 428 aa  163  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  28.27 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  28.27 
 
 		 444 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  28.27 
 
 		 444 aa  162  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  28.27 
 
 		 444 aa  162  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  28.27 
 
 		 444 aa  162  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  28.27 
 
 		 444 aa  162  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  28.27 
 
 		 444 aa  162  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>