More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0217 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0225  d-galactonate transporter  99.55 
 
 		 446 aa  887    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305819 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  73.46 
 
 		 450 aa  639    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3397  D-galactonate transporter  95.07 
 
 		 446 aa  821    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2810  D-galactonate transporter  95.52 
 
 		 446 aa  789    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0217  d-galactonate transporter  100 
 
 		 446 aa  888    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0202  d-galactonate transporter  92.83 
 
 		 446 aa  783    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317635  unclonable  0.00000000000905697 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0277  d-galactonate transporter  95.52 
 
 		 446 aa  790    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370556 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0296  d-galactonate transporter  95.52 
 
 		 446 aa  789    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106935  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  71.85 
 
 		 450 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  71.85 
 
 		 450 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0187  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  70.94 
 
 		 451 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  64.99 
 
 		 445 aa  592  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  61.56 
 
 		 461 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  61.56 
 
 		 461 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  63.81 
 
 		 463 aa  572  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  63.34 
 
 		 454 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  63.34 
 
 		 454 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  62.88 
 
 		 453 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  61.66 
 
 		 468 aa  565  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  62.88 
 
 		 454 aa  564  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  60.09 
 
 		 450 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  59.78 
 
 		 450 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  60.9 
 
 		 451 aa  563  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  60 
 
 		 450 aa  559  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6596  d-galactonate transporter  62.56 
 
 		 457 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143418  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  59.78 
 
 		 450 aa  557  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  61.43 
 
 		 452 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  61.43 
 
 		 452 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  61.43 
 
 		 452 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  59.78 
 
 		 450 aa  557  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  59.78 
 
 		 450 aa  557  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  59.78 
 
 		 450 aa  557  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  62.22 
 
 		 451 aa  555  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  59.78 
 
 		 450 aa  557  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  61.43 
 
 		 452 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  59.78 
 
 		 450 aa  557  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  61.43 
 
 		 452 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  59.78 
 
 		 450 aa  557  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  60.97 
 
 		 440 aa  552  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  61.01 
 
 		 458 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0807  d-galactonate transporter  59.33 
 
 		 450 aa  539  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  59.05 
 
 		 450 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0841  d-galactonate transporter  61.2 
 
 		 450 aa  535  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  59.03 
 
 		 485 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  59.68 
 
 		 450 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  58.59 
 
 		 485 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  55.35 
 
 		 444 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  55.35 
 
 		 444 aa  526  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  59.07 
 
 		 458 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0327  D-galactonate transporter  59.82 
 
 		 459 aa  527  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  55.35 
 
 		 444 aa  526  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  55.35 
 
 		 444 aa  526  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  55.35 
 
 		 444 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  55.35 
 
 		 444 aa  526  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  55.35 
 
 		 444 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  55.35 
 
 		 444 aa  526  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  55.86 
 
 		 444 aa  524  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4735  galactarate transporter  60.65 
 
 		 453 aa  520  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388057  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3044  D-galactonate transporter  58.72 
 
 		 464 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5322  d-galactonate transporter  58.72 
 
 		 464 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1217  d-galactonate transporter  57.18 
 
 		 446 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26743  normal  0.06903 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4946  d-galactonate transporter  59.35 
 
 		 435 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.899086  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  51.86 
 
 		 455 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  51.75 
 
 		 454 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  52.21 
 
 		 454 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  52.21 
 
 		 454 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  51.17 
 
 		 447 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  52.21 
 
 		 454 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  50.68 
 
 		 447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  45.58 
 
 		 438 aa  413  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3916  probable glucarate transporter  45.27 
 
 		 436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3978  putative glucarate transporter  45.27 
 
 		 436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.776069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4023  glucarate transporter  45.27 
 
 		 436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.957782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4084  probable glucarate transporter  45.27 
 
 		 436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.463281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  44.24 
 
 		 442 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.35 
 
 		 456 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  41.35 
 
 		 447 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  41.12 
 
 		 447 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  41.5 
 
 		 434 aa  359  5e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  41.12 
 
 		 447 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  40.84 
 
 		 449 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  41.12 
 
 		 436 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  41.12 
 
 		 436 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  41.61 
 
 		 467 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  41.07 
 
 		 450 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  42.19 
 
 		 448 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  41.82 
 
 		 478 aa  352  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  40.84 
 
 		 458 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  39.86 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  39.74 
 
 		 455 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2344  major facilitator transporter  41.55 
 
 		 449 aa  347  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  41.19 
 
 		 446 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  41.19 
 
 		 446 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  42.82 
 
 		 448 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  42.82 
 
 		 448 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  42.82 
 
 		 448 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  42.82 
 
 		 448 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  42.82 
 
 		 448 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  42.82 
 
 		 448 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  42.82 
 
 		 448 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>