More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2587 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  83.85 
 
 
424 aa  733    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2587  major facilitator transporter  100 
 
 
425 aa  847    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2535  major facilitator transporter  100 
 
 
425 aa  847    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  43.82 
 
 
440 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  30.26 
 
 
448 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2672  major facilitator transporter  30.32 
 
 
433 aa  189  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529284  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0963  major facilitator transporter  29.62 
 
 
454 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 
442 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  30.36 
 
 
468 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  30.51 
 
 
428 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  28.87 
 
 
461 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  30.43 
 
 
461 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  26.64 
 
 
430 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  29.16 
 
 
453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  28.83 
 
 
428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  30.09 
 
 
467 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 
432 aa  172  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 
453 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6079  major facilitator transporter  31.1 
 
 
413 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  31.79 
 
 
449 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  27.6 
 
 
428 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  32.09 
 
 
433 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  30 
 
 
428 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  27.59 
 
 
439 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  30 
 
 
428 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  28.79 
 
 
435 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  28.72 
 
 
430 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  30.59 
 
 
446 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  28.09 
 
 
431 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  30.08 
 
 
446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  28.79 
 
 
432 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4215  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 
438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.528706 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  28.82 
 
 
450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  31.03 
 
 
432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  29.64 
 
 
426 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  27.93 
 
 
463 aa  163  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  27.15 
 
 
444 aa  162  9e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  27.15 
 
 
444 aa  162  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  27.15 
 
 
444 aa  162  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  27.15 
 
 
444 aa  162  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  28.57 
 
 
440 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  27.15 
 
 
444 aa  162  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  27.15 
 
 
444 aa  162  9e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  27.15 
 
 
444 aa  162  9e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  28.57 
 
 
440 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  27.08 
 
 
444 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  29.64 
 
 
426 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  29.53 
 
 
466 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  29.64 
 
 
426 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  28.54 
 
 
450 aa  160  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  29.67 
 
 
438 aa  159  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3260  major facilitator family transporter  27.67 
 
 
451 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3034  major facilitator family transporter  27.43 
 
 
450 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.883875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2955  major facilitator family transporter  27.67 
 
 
450 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3474  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
415 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00256717  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0225  d-galactonate transporter  28.1 
 
 
446 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305819 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3267  major facilitator family transporter  27.43 
 
 
450 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4023  glucarate transporter  29.9 
 
 
436 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.957782  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
434 aa  158  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3978  putative glucarate transporter  29.9 
 
 
436 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.776069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  29.8 
 
 
445 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0217  d-galactonate transporter  28.1 
 
 
446 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3916  probable glucarate transporter  29.9 
 
 
436 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4084  probable glucarate transporter  29.9 
 
 
436 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.463281  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 
431 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  29.05 
 
 
439 aa  156  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  28.95 
 
 
439 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  27.69 
 
 
454 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  31.39 
 
 
440 aa  156  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3397  D-galactonate transporter  28.24 
 
 
446 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 
442 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  27.54 
 
 
444 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  28.29 
 
 
450 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  28.95 
 
 
439 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  29.35 
 
 
432 aa  155  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  28.95 
 
 
439 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  27.25 
 
 
454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  27.25 
 
 
454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 
427 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  27.64 
 
 
429 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  28.83 
 
 
434 aa  152  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  28.61 
 
 
436 aa  152  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4990  major facilitator transporter  29.7 
 
 
431 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214245  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  27.68 
 
 
453 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6462  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 
453 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.320121  hitchhiker  0.0000481514 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0202  d-galactonate transporter  28.64 
 
 
446 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317635  unclonable  0.00000000000905697 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  27.59 
 
 
450 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  27.59 
 
 
450 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 
433 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  25 
 
 
433 aa  151  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 
430 aa  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  26.92 
 
 
428 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  26.92 
 
 
428 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  28.64 
 
 
434 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  26.92 
 
 
428 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0477  major facilitator transporter  26.59 
 
 
441 aa  150  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 
433 aa  150  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.52 
 
 
448 aa  149  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  30.25 
 
 
451 aa  150  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  26.92 
 
 
428 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>