More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_51130 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  100 
 
 		 439 aa  883    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  82.84 
 
 		 480 aa  748    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  82.84 
 
 		 441 aa  749    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02062  putative transporter transmembrane protein  74.06 
 
 		 441 aa  635    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000104941  normal  0.781434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  82.18 
 
 		 439 aa  744    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  82.7 
 
 		 442 aa  724    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  82.48 
 
 		 442 aa  740    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  72.54 
 
 		 441 aa  665    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  79.44 
 
 		 445 aa  726    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  82.83 
 
 		 441 aa  743    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  84.33 
 
 		 441 aa  746    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  83.95 
 
 		 432 aa  730    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4873  major facilitator transporter  64.93 
 
 		 501 aa  554  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  45.41 
 
 		 433 aa  368  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  42.37 
 
 		 427 aa  343  4e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  41 
 
 		 439 aa  338  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  41.81 
 
 		 431 aa  332  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  40.83 
 
 		 424 aa  328  8e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  41.4 
 
 		 436 aa  328  9e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  40.72 
 
 		 454 aa  326  7e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  41.8 
 
 		 449 aa  316  6e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  40.57 
 
 		 432 aa  316  6e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 430 aa  314  2.9999999999999996e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  41.06 
 
 		 426 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  40.24 
 
 		 430 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  40 
 
 		 430 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  40 
 
 		 430 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  41.13 
 
 		 431 aa  309  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  37.86 
 
 		 430 aa  308  9e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  41.61 
 
 		 429 aa  308  9e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  40.25 
 
 		 429 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  40.3 
 
 		 430 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  40.3 
 
 		 430 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  40.87 
 
 		 457 aa  299  7e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  37.75 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  39.52 
 
 		 429 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  38.69 
 
 		 453 aa  292  9e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  37.2 
 
 		 449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  37.32 
 
 		 435 aa  271  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2272  major facilitator superfamily MFS_1  35.91 
 
 		 479 aa  248  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.972023  decreased coverage  0.00181869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4265  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 489 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762522  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1666  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 411 aa  237  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 428 aa  226  6e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2448  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 409 aa  223  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581947  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  34.49 
 
 		 424 aa  213  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 441 aa  213  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  31.78 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 434 aa  202  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  31.78 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  35.17 
 
 		 430 aa  201  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 411 aa  199  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3658  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 432 aa  193  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0258  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 440 aa  190  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2627  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 436 aa  188  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 429 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  30.17 
 
 		 434 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  29.95 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  29.95 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  29.95 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 423 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2353  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 436 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  29.7 
 
 		 434 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1642  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 		 432 aa  182  9.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.3142  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1611  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 		 433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.585379  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1313  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.720769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 430 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 		 430 aa  176  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03520  conserved hypothetical protein  30.31 
 
 		 452 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03471  hypothetical protein  30.31 
 
 		 452 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4207  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 423 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0961062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4159  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 423 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  decreased coverage  0.00263409 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4048  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 423 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3566  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 443 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000684429  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  30.74 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2920  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 448 aa  172  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.43898  normal  0.655639 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 423 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  29.33 
 
 		 435 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3599  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 435 aa  166  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00583195  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3361  putative hexuronate transporter  29.72 
 
 		 435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0926  putative hexuronate transporter  29.47 
 
 		 435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0978  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  29.03 
 
 		 448 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3529  hexuronate transporter  29.57 
 
 		 432 aa  162  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 436 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5219  MFS transporter, phthalate permease family  31.75 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 432 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 425 aa  160  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  29.57 
 
 		 472 aa  160  6e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>