More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3956 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  80.14 
 
 		 431 aa  699    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 449 aa  893    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  64.05 
 
 		 432 aa  556  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  62.41 
 
 		 431 aa  557  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  62.06 
 
 		 426 aa  541  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  59.2 
 
 		 439 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  57.58 
 
 		 430 aa  526  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  56.1 
 
 		 454 aa  501  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  55.11 
 
 		 436 aa  492  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  50.68 
 
 		 453 aa  425  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  47.22 
 
 		 441 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  48.38 
 
 		 424 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  46.82 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  47.76 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  46.82 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  46.82 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  46.46 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  46.46 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  44.58 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  46.23 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  45.31 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 430 aa  359  6e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 468 aa  353  4e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  42.18 
 
 		 429 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 441 aa  319  7e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  41.5 
 
 		 449 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  41.8 
 
 		 439 aa  316  6e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  40.81 
 
 		 480 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  40.81 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  40.57 
 
 		 441 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  40.67 
 
 		 439 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  40.35 
 
 		 442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  40.67 
 
 		 442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 445 aa  302  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  38.9 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 457 aa  295  9e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  40.47 
 
 		 435 aa  292  8e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  39.52 
 
 		 432 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  37.78 
 
 		 441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02062  putative transporter transmembrane protein  40.1 
 
 		 441 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000104941  normal  0.781434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4265  major facilitator transporter  36.21 
 
 		 489 aa  280  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762522  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4873  major facilitator transporter  38.83 
 
 		 501 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2272  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 		 479 aa  265  8.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.972023  decreased coverage  0.00181869 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1666  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 411 aa  257  3e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  36.91 
 
 		 428 aa  256  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  34.77 
 
 		 435 aa  238  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2448  major facilitator transporter  34.06 
 
 		 409 aa  237  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581947  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  35.06 
 
 		 424 aa  236  6e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 		 420 aa  236  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  34.74 
 
 		 425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  34.74 
 
 		 425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 		 430 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  34.7 
 
 		 435 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 429 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3529  hexuronate transporter  34.26 
 
 		 432 aa  225  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3561  putative hexuronate transporter  34.33 
 
 		 432 aa  225  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  34.33 
 
 		 472 aa  225  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02913  hypothetical protein  34.33 
 
 		 472 aa  225  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  33.41 
 
 		 433 aa  223  7e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  33.65 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  38.6 
 
 		 425 aa  220  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  35.9 
 
 		 432 aa  219  6e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  34.14 
 
 		 423 aa  219  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3547  d-galactonate transporter  33.33 
 
 		 474 aa  218  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.48586 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 411 aa  217  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1105  putative hexuronate MFS transporter ExuT  33.33 
 
 		 434 aa  216  5e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000998284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0553  d-galactonate transporter  33.33 
 
 		 434 aa  216  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.351291  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0490  putative hexuronate MFS transporter ExuT  33.33 
 
 		 433 aa  216  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.40951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4322  d-galactonate transporter  33.18 
 
 		 432 aa  216  9e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0608  d-galactonate transporter  34.33 
 
 		 432 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0607  d-galactonate transporter  34.33 
 
 		 432 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3276  putative hexuronate transporter  34.33 
 
 		 432 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4408  hexuronate transporter  34.33 
 
 		 432 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.591703 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3658  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 432 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3385  hexuronate transporter  34.26 
 
 		 432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  32.48 
 
 		 434 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3512  d-galactonate transporter  32.94 
 
 		 433 aa  212  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  32.24 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  32.24 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  32.24 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  32.01 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0258  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 440 aa  210  4e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3386  d-galactonate transporter  32.55 
 
 		 434 aa  209  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3566  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 443 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000684429  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4048  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 423 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4207  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 423 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0961062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4159  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 423 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  decreased coverage  0.00263409 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 436 aa  202  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1806  major facilitator superfamily metabolite(phthalate/hexuronate)/H(+) symporter  32.79 
 
 		 433 aa  202  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119934 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4857  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 		 430 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133188  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>