More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5549 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5549  major facilitator transporter  100 
 
 		 450 aa  883    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  58.27 
 
 		 419 aa  475  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 410 aa  408  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  36.1 
 
 		 448 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  36.73 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  36.66 
 
 		 449 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 447 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 		 443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  35.76 
 
 		 428 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  35.35 
 
 		 449 aa  242  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 450 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  35.09 
 
 		 446 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  36.38 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  36.04 
 
 		 453 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.41 
 
 		 456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  36.79 
 
 		 448 aa  236  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  37.14 
 
 		 448 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  37.14 
 
 		 448 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  37.14 
 
 		 448 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  37.14 
 
 		 448 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  37.14 
 
 		 448 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  37.14 
 
 		 448 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  37.14 
 
 		 448 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  34.86 
 
 		 458 aa  236  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 435 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  36.23 
 
 		 444 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 442 aa  232  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 436 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  33.64 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 467 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 436 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 		 453 aa  227  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 446 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  34.43 
 
 		 438 aa  226  7e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 436 aa  226  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  33.26 
 
 		 485 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 		 432 aa  219  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  33.11 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  34.4 
 
 		 458 aa  216  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  32.54 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  32.1 
 
 		 434 aa  216  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  35.08 
 
 		 452 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  35.08 
 
 		 452 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  35.08 
 
 		 452 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  32.81 
 
 		 451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  35.08 
 
 		 452 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  33.78 
 
 		 450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  35.08 
 
 		 452 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3044  D-galactonate transporter  33.26 
 
 		 464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5322  d-galactonate transporter  33.26 
 
 		 464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 463 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 463 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  33.56 
 
 		 450 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  32.78 
 
 		 436 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  33.56 
 
 		 450 aa  213  7e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  32.72 
 
 		 444 aa  213  7e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  32.72 
 
 		 444 aa  213  7e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  32.72 
 
 		 444 aa  213  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  33.56 
 
 		 450 aa  213  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  32.72 
 
 		 444 aa  213  7e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  32.72 
 
 		 444 aa  213  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  32.72 
 
 		 444 aa  213  7e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  33.56 
 
 		 450 aa  213  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  33.56 
 
 		 450 aa  213  7e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  32.72 
 
 		 444 aa  213  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  33.56 
 
 		 450 aa  213  7e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  33.56 
 
 		 450 aa  213  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 450 aa  212  9e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  33.64 
 
 		 451 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 463 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4735  galactarate transporter  33.8 
 
 		 453 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388057  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  34.25 
 
 		 440 aa  211  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  32.72 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  32.87 
 
 		 447 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0327  D-galactonate transporter  33.33 
 
 		 459 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 461 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  31.53 
 
 		 429 aa  211  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 464 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 479 aa  210  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  32.03 
 
 		 450 aa  210  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 469 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  33.26 
 
 		 450 aa  210  5e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  33.71 
 
 		 450 aa  209  6e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 433 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  31.64 
 
 		 450 aa  209  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  33.11 
 
 		 444 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4946  d-galactonate transporter  33.72 
 
 		 435 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.899086  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0807  d-galactonate transporter  31.7 
 
 		 450 aa  208  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  33.11 
 
 		 458 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  33.18 
 
 		 436 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  30.88 
 
 		 432 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  30.88 
 
 		 432 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  32.58 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  32.07 
 
 		 478 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  30.88 
 
 		 432 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>