More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8624 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8624  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 461 aa  910    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.860223  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  50.23 
 
 		 456 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0477  major facilitator transporter  46.82 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  28.29 
 
 		 448 aa  176  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 440 aa  170  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  29.5 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  29.54 
 
 		 446 aa  162  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  27.05 
 
 		 447 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  28.72 
 
 		 485 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  28.51 
 
 		 485 aa  156  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 		 432 aa  156  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  26.9 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 431 aa  154  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  28.03 
 
 		 458 aa  153  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4084  probable glucarate transporter  27.33 
 
 		 436 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.463281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4023  glucarate transporter  27.33 
 
 		 436 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.957782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3978  putative glucarate transporter  27.33 
 
 		 436 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.776069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3916  probable glucarate transporter  27.33 
 
 		 436 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  27.67 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  27.67 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  27.67 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  27.67 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  27.67 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  26.54 
 
 		 454 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  27.67 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  27.67 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  27.67 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 439 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 439 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  26.54 
 
 		 454 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  27.49 
 
 		 463 aa  151  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 439 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  26.54 
 
 		 454 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  27.69 
 
 		 458 aa  150  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0327  D-galactonate transporter  28.03 
 
 		 459 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 469 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  26 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  28 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  27.38 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  25.9 
 
 		 446 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 455 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  27.79 
 
 		 444 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 446 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4735  galactarate transporter  28.22 
 
 		 453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388057  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3044  D-galactonate transporter  28.87 
 
 		 464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5322  d-galactonate transporter  28.87 
 
 		 464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  26 
 
 		 461 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  26.22 
 
 		 468 aa  147  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 439 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 439 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  27.91 
 
 		 430 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  25.98 
 
 		 428 aa  146  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  26.8 
 
 		 430 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  25.23 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  26.8 
 
 		 430 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  27.69 
 
 		 430 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  27.69 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  25.75 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  25.75 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  26.22 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  27.69 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  27.69 
 
 		 430 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  25.75 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  27.17 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 454 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  26.17 
 
 		 447 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  27.17 
 
 		 454 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  27.17 
 
 		 454 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  25.75 
 
 		 428 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 467 aa  143  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  28 
 
 		 436 aa  143  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  26.22 
 
 		 436 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  27.03 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4946  d-galactonate transporter  28.96 
 
 		 435 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.899086  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 443 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 432 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  27.47 
 
 		 430 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  27.53 
 
 		 450 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  23.87 
 
 		 450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  26.88 
 
 		 432 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  26.88 
 
 		 432 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  26.88 
 
 		 432 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  23.87 
 
 		 450 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2535  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2587  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>