More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0884 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0884  major facilitator transporter  100 
 
 		 394 aa  778    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 409 aa  285  7e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3235  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 		 404 aa  252  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 417 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3710  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 408 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.010262 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 460 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  29.09 
 
 		 463 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0477  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 441 aa  143  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  28.98 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  28.98 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 430 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  26.77 
 
 		 427 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  28.27 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  28.74 
 
 		 453 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 438 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4735  galactarate transporter  26.67 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388057  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  28.5 
 
 		 448 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.87 
 
 		 460 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4133  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4020  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  27.23 
 
 		 461 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.3 
 
 		 446 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  27.48 
 
 		 436 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  27.08 
 
 		 468 aa  133  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  27.46 
 
 		 461 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  27.46 
 
 		 447 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  26.95 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  26.95 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  26.95 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  26.95 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  26.68 
 
 		 445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  26.95 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  26.95 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  26.95 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  26.95 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  27.23 
 
 		 444 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  24.58 
 
 		 447 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 428 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  26.44 
 
 		 448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 427 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1217  d-galactonate transporter  26.14 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26743  normal  0.06903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3397  D-galactonate transporter  27.68 
 
 		 446 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  26.39 
 
 		 458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  26.88 
 
 		 432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  26.88 
 
 		 432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  26.88 
 
 		 432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 442 aa  126  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 440 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  26.02 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  26.02 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  25.43 
 
 		 449 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0225  d-galactonate transporter  26.29 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305819 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  26.02 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  26.02 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  26.02 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0217  d-galactonate transporter  26.29 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  26.02 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  26.02 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 454 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  25.31 
 
 		 452 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  25.31 
 
 		 450 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  24.71 
 
 		 454 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  26.97 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  24.47 
 
 		 454 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  25.31 
 
 		 440 aa  124  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  24.47 
 
 		 454 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 428 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  25.31 
 
 		 450 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 432 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  25.31 
 
 		 450 aa  124  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  25.31 
 
 		 452 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  25.31 
 
 		 450 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  25.31 
 
 		 452 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  25.31 
 
 		 450 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  25.31 
 
 		 452 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  25.31 
 
 		 450 aa  124  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  25.31 
 
 		 450 aa  124  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  25.31 
 
 		 452 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  25.98 
 
 		 428 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  24.94 
 
 		 447 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  25.98 
 
 		 428 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  25.98 
 
 		 428 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  25.98 
 
 		 428 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  26.53 
 
 		 450 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  26.35 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  25.31 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  25.91 
 
 		 430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  25.91 
 
 		 445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  25.91 
 
 		 445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  26.97 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  26 
 
 		 449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>