More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3790 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A5429  phosphoglycerate transporter family protein  88.66 
 
 
444 aa  810    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5375  phosphoglycerate transporter family protein  88.66 
 
 
444 aa  810    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5109  phosphoglycerate transporter family protein  88.44 
 
 
444 aa  810    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4940  glycerol-3-phosphate transporter  87.44 
 
 
444 aa  805    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4955  glycerol-3-phosphate transporter  87.89 
 
 
444 aa  807    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5349  phosphoglycerate transporter family protein  88.21 
 
 
444 aa  808    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5500  phosphoglycerate transporter family protein  88.44 
 
 
444 aa  810    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5381  phosphoglycerate transporter family protein  88.21 
 
 
444 aa  812    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3790  phosphoglycerate transporter  100 
 
 
446 aa  903    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5051  phosphoglycerate transporter  87.98 
 
 
444 aa  810    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5573  phosphoglycerate transporter family protein  88.44 
 
 
444 aa  813    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  50.24 
 
 
445 aa  455  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  50.24 
 
 
445 aa  455  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0718  glycerol-3-phosphate transporter  47.32 
 
 
449 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000170433 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0729  glycerol-3-phosphate transporter  46.78 
 
 
449 aa  408  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0628  glycerol-3-phosphate transporter  47.54 
 
 
449 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000215527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0572  glycerol-3-phosphate transporter  47.32 
 
 
449 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00224555  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0661  glycerol-3-phosphate transporter  47.54 
 
 
449 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00772133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0571  glycerol-3-phosphate transporter  46.88 
 
 
449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00198632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0790  glycerol-3-phosphate transporter  46.56 
 
 
449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000864698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4646  glycerol-3-phosphate transporter  48.38 
 
 
449 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000791973  unclonable  8.6547e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0575  glycerol-3-phosphate transporter  46.86 
 
 
449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0692  glycerol-3-phosphate transporter  48.38 
 
 
449 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0556  glycerol-3-phosphate transporter  46.86 
 
 
449 aa  402  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000367094  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2870  glycerol-3-phosphate transporter  45.58 
 
 
445 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1713  sn-glycerol-3-phosphate transporter  45.11 
 
 
483 aa  397  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0001  sn-glycerol-3-phosphate transporter  46.22 
 
 
452 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000530916  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2629  phosphoglycerate transport: transporter  44.19 
 
 
463 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2653  phosphoglycerate transport: transporter  44.19 
 
 
463 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132768 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2588  phosphoglycerate transport: transporter  44.19 
 
 
463 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2540  phosphoglycerate transport: transporter  44.19 
 
 
463 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2759  phosphoglycerate transporter  44.19 
 
 
463 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03311  sn-glycerol-3-phosphate transporter  45.27 
 
 
455 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  43.92 
 
 
448 aa  383  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002677  glycerol-3-phosphate transporter  44.84 
 
 
454 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3298  sn-glycerol-3-phosphate transporter  44.89 
 
 
457 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02166  sn-glycerol-3-phosphate transporter  43.89 
 
 
452 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2392  sn-glycerol-3-phosphate transporter  43.89 
 
 
452 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1419  glycerol-3-phosphate transporter  43.72 
 
 
452 aa  375  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2537  sn-glycerol-3-phosphate transporter  43.89 
 
 
452 aa  375  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5238  glycerol-3-phosphate transporter  44.37 
 
 
449 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0305  sn-glycerol-3-phosphate transporter  44.6 
 
 
449 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  44.57 
 
 
446 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2380  sn-glycerol-3-phosphate transporter  43.89 
 
 
452 aa  375  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1411  sn-glycerol-3-phosphate transporter  43.72 
 
 
452 aa  375  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3377  sn-glycerol-3-phosphate transporter  43.89 
 
 
452 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2622  sn-glycerol-3-phosphate transporter  43.89 
 
 
452 aa  375  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02125  hypothetical protein  43.89 
 
 
452 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2511  sn-glycerol-3-phosphate transporter  44.34 
 
 
452 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5451  sn-glycerol-3-phosphate transporter  44.91 
 
 
449 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00923139 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2419  sn-glycerol-3-phosphate transporter  44.34 
 
 
452 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2468  sn-glycerol-3-phosphate transporter  44.34 
 
 
452 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0862405 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2627  sn-glycerol-3-phosphate transporter  44.34 
 
 
452 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.588856 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2523  sn-glycerol-3-phosphate transporter  44.34 
 
 
452 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3958  sn-glycerol-3-phosphate transporter  43.82 
 
 
449 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00220837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5978  sn-glycerol-3-phosphate transporter  44.29 
 
 
448 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69130  sn-glycerol-3-phosphate transporter  44.52 
 
 
448 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0395  glycerol-3-phosphate transporter  43.5 
 
 
452 aa  362  8e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0536129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0385  glycerol-3-phosphate transporter  43.5 
 
 
452 aa  362  8e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000112087  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0225  sn-glycerol-3-phosphate transporter  45.17 
 
 
450 aa  360  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2060  glycerol-3-phosphate transporter  43.24 
 
 
452 aa  359  6e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2804  sn-glycerol-3-phosphate transporter  43.44 
 
 
450 aa  356  5.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal  0.676266 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0247  sn-glycerol-3-phosphate transporter  41.33 
 
 
450 aa  355  7.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0274937  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  43.21 
 
 
451 aa  355  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.140488  normal  0.0295712 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  42.63 
 
 
449 aa  352  7e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000543007  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4149  sn-glycerol-3-phosphate transporter  43.15 
 
 
449 aa  349  5e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000087639  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0511  glycerol 3-phosphate transporter  39.41 
 
 
481 aa  342  5e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000061877  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  36.66 
 
 
443 aa  280  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0573  glycerol-3-phosphatase transporter  34.82 
 
 
459 aa  272  7e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.167538  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  32.73 
 
 
446 aa  267  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4078  regulatory protein UhpC  36.04 
 
 
443 aa  262  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0083  regulatory protein UhpC  36.04 
 
 
443 aa  262  8.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.644662  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4130  regulatory protein UhpC  36.15 
 
 
453 aa  262  8.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.543128  normal  0.246836 
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  34.35 
 
 
456 aa  257  3e-67  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5097  regulatory protein UhpC  34.47 
 
 
439 aa  256  5e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.113676 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03551  membrane protein regulates uhpT expression  34.47 
 
 
439 aa  256  6e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0036  phosphoglycerate transporter  34.47 
 
 
439 aa  256  6e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3880  regulatory protein UhpC  34.47 
 
 
439 aa  256  6e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0032  regulatory protein UhpC  34.47 
 
 
439 aa  256  6e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03493  hypothetical protein  34.47 
 
 
439 aa  256  6e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4032  regulatory protein UhpC  34.25 
 
 
439 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.47751 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4252  regulatory protein UhpC  34.47 
 
 
439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4175  regulatory protein UhpC  34.25 
 
 
439 aa  254  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3502  regulatory protein UhpC  33.56 
 
 
447 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0029  regulatory protein UhpC  34.18 
 
 
442 aa  250  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  33.64 
 
 
446 aa  249  5e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  33.64 
 
 
441 aa  248  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1436  glycerol-3-phosphate transporter, putative  35.09 
 
 
457 aa  247  3e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000217705  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0834  major facilitator transporter  33.17 
 
 
433 aa  247  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  33.18 
 
 
455 aa  245  9e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  32.96 
 
 
455 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4014  regulatory protein UhpC  33.71 
 
 
442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4069  regulatory protein UhpC  34.16 
 
 
442 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4119  regulatory protein UhpC  33.93 
 
 
442 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0624  regulatory protein UhpC  31.78 
 
 
436 aa  243  5e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3998  regulatory protein UhpC  33.93 
 
 
442 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4177  regulatory protein UhpC  33.93 
 
 
442 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1684  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 
422 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.597788  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 
437 aa  238  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0436  regulatory protein UhpC  33.83 
 
 
434 aa  237  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>