More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_03471 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3361  putative hexuronate transporter  73.32 
 
 
435 aa  643    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03520  conserved hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  911    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3599  major facilitator transporter  73.21 
 
 
435 aa  651    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00583195  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03471  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  911    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1611  major facilitator superfamily MFS_1  77.49 
 
 
433 aa  684    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.585379  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1313  major facilitator transporter  83.1 
 
 
433 aa  757    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.720769  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2353  major facilitator superfamily MFS_1  79.81 
 
 
436 aa  724    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2627  major facilitator superfamily MFS_1  80.28 
 
 
436 aa  724    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1642  major facilitator superfamily MFS_1  78.42 
 
 
432 aa  684    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.3142  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0926  putative hexuronate transporter  73.55 
 
 
435 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0978  major facilitator transporter  73.55 
 
 
435 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  45.61 
 
 
430 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  45.82 
 
 
423 aa  395  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  45.61 
 
 
430 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  46.59 
 
 
432 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  45.3 
 
 
435 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3566  major facilitator transporter  44.65 
 
 
443 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000684429  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4207  major facilitator transporter  45.35 
 
 
423 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0961062  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4048  major facilitator transporter  45.11 
 
 
423 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4159  major facilitator transporter  45.35 
 
 
423 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  decreased coverage  0.00263409 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  45.35 
 
 
423 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  43.57 
 
 
434 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  43.33 
 
 
434 aa  362  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  43.33 
 
 
434 aa  362  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  43.33 
 
 
434 aa  362  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  43.33 
 
 
434 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  42.18 
 
 
472 aa  354  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3561  putative hexuronate transporter  42.75 
 
 
432 aa  354  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02913  hypothetical protein  42.18 
 
 
472 aa  354  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  41.15 
 
 
433 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  41.15 
 
 
433 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  42.89 
 
 
425 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  42.89 
 
 
425 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  41.79 
 
 
433 aa  348  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0490  putative hexuronate MFS transporter ExuT  41.53 
 
 
433 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.40951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1105  putative hexuronate MFS transporter ExuT  41.53 
 
 
434 aa  347  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000998284  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0553  d-galactonate transporter  41.53 
 
 
434 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.351291  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  41.79 
 
 
433 aa  347  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3529  hexuronate transporter  42.27 
 
 
432 aa  347  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  42.13 
 
 
430 aa  346  5e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0608  d-galactonate transporter  42.75 
 
 
432 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3276  putative hexuronate transporter  42.75 
 
 
432 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4408  hexuronate transporter  42.75 
 
 
432 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.591703 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0607  d-galactonate transporter  42.75 
 
 
432 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3385  hexuronate transporter  42.75 
 
 
432 aa  345  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4322  d-galactonate transporter  42.17 
 
 
432 aa  344  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  41.55 
 
 
435 aa  343  5e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3386  d-galactonate transporter  42.34 
 
 
434 aa  342  5.999999999999999e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3547  d-galactonate transporter  41.26 
 
 
474 aa  342  7e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.48586 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3512  d-galactonate transporter  42.13 
 
 
433 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  41.23 
 
 
429 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  40.46 
 
 
411 aa  317  3e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0935  major facilitator transporter  40.1 
 
 
427 aa  309  5.9999999999999995e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.881993  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5219  MFS transporter, phthalate permease family  39.9 
 
 
436 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4857  major facilitator superfamily MFS_1  39.51 
 
 
430 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133188  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0325  general substrate transporter:TonB box, N-terminal  40.55 
 
 
436 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000282343  normal  0.265981 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1806  major facilitator superfamily metabolite(phthalate/hexuronate)/H(+) symporter  38.92 
 
 
433 aa  292  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0119934 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  33.08 
 
 
433 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 
434 aa  204  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 
441 aa  202  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  29.22 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  30.16 
 
 
430 aa  199  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 
431 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  28.71 
 
 
424 aa  197  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  32.87 
 
 
439 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 
426 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  32.87 
 
 
442 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 
432 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  29.78 
 
 
441 aa  189  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 
436 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  30.87 
 
 
441 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  31.06 
 
 
424 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 
430 aa  188  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  30.94 
 
 
442 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  31.31 
 
 
441 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  31.31 
 
 
441 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  31.31 
 
 
480 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  30.71 
 
 
441 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  32.8 
 
 
435 aa  179  9e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 
431 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 
425 aa  178  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  29.44 
 
 
427 aa  176  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  30.31 
 
 
439 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 
439 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  28.43 
 
 
429 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  27.36 
 
 
424 aa  171  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 
449 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 
420 aa  170  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  29.15 
 
 
430 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  29.15 
 
 
430 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  29.85 
 
 
445 aa  170  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  28.47 
 
 
430 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  28.89 
 
 
429 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  28.17 
 
 
436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  28.22 
 
 
430 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  30.54 
 
 
432 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  28.64 
 
 
430 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4873  major facilitator transporter  30.41 
 
 
501 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  27.09 
 
 
434 aa  163  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 
429 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>