176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0333 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0333  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 408 aa  817    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0639  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 437 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 415 aa  87.4  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  27.06 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  25 
 
 		 439 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  22.93 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  22.03 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  20.96 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  20.96 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  22.03 
 
 		 486 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  20.91 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  21.23 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  21.16 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  20.91 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  20.91 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  20.91 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0298  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  24.18 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4647  major facilitator transporter  22.68 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  24.66 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1376  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.757312  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  25 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  21.13 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  21.47 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  21.07 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  22.66 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  20.05 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0640  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 425 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  22.98 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 432 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  20.68 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  25.43 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 442 aa  57  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 		 442 aa  56.2  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  24.9 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3527  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  24.04 
 
 		 407 aa  54.7  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  21.66 
 
 		 400 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  21.66 
 
 		 400 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  21.33 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0480  major facilitator transporter  22.66 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  24.33 
 
 		 425 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  21.48 
 
 		 421 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  22.4 
 
 		 400 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  21.66 
 
 		 400 aa  53.5  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  21.66 
 
 		 400 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  21.66 
 
 		 400 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 435 aa  53.5  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0305  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 432 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382232  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 457 aa  53.1  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 436 aa  53.1  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1022  major facilitator superfamily MFS_1  24.28 
 
 		 412 aa  53.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  21.3 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  22.4 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 427 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  21.16 
 
 		 421 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1883  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 		 421 aa  51.2  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  21.27 
 
 		 398 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  21.27 
 
 		 398 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  21.27 
 
 		 398 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69130  sn-glycerol-3-phosphate transporter  26.26 
 
 		 448 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  23.27 
 
 		 442 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  21.01 
 
 		 398 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  21.01 
 
 		 398 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  21.81 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 408 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 431 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 441 aa  50.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  23.01 
 
 		 411 aa  50.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 426 aa  50.4  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5978  sn-glycerol-3-phosphate transporter  26.82 
 
 		 448 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 427 aa  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  21.12 
 
 		 421 aa  49.7  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>