More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1883 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1883  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 421 aa  828    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0557  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0349703  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0905  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  25.86 
 
 		 448 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 432 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  25.81 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  23.58 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  22.04 
 
 		 453 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  22.51 
 
 		 454 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  23.08 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  22.51 
 
 		 454 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  22.95 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  22.95 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  22.95 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  24.27 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  22.04 
 
 		 454 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  22.71 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  22.95 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4252  regulatory protein UhpC  26.62 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  23.41 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4069  regulatory protein UhpC  26.62 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 434 aa  73.2  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  22.01 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03551  membrane protein regulates uhpT expression  26.62 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0036  phosphoglycerate transporter  26.62 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3880  regulatory protein UhpC  26.62 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03493  hypothetical protein  26.62 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  23.49 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4014  regulatory protein UhpC  26.62 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0032  regulatory protein UhpC  26.62 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3998  regulatory protein UhpC  26.24 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5097  regulatory protein UhpC  26.62 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.113676 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4119  regulatory protein UhpC  26.24 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4032  regulatory protein UhpC  26.62 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.47751 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4177  regulatory protein UhpC  26.24 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.72 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3502  regulatory protein UhpC  25.67 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4175  regulatory protein UhpC  26.24 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1737  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  30.81 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  25.82 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 430 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  25.09 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 437 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  24.39 
 
 		 455 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  24.39 
 
 		 455 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  25.96 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  24.38 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 451 aa  68.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  23.44 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 431 aa  67  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  22.62 
 
 		 444 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  22.62 
 
 		 444 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  22.62 
 
 		 444 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  22.62 
 
 		 444 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  22.62 
 
 		 444 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  22.07 
 
 		 430 aa  67  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  22.62 
 
 		 444 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  22.62 
 
 		 444 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0556  glycerol-3-phosphate transporter  26.19 
 
 		 449 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000367094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  21.93 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0029  regulatory protein UhpC  26.24 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  22.68 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  22.05 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  25.07 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  22.34 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  25.07 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>