More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1109 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  100 
 
 
426 aa  843    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  40.8 
 
 
437 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  40.58 
 
 
432 aa  361  1e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  29.86 
 
 
421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  28.54 
 
 
422 aa  182  7e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  27.92 
 
 
436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0530  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 
443 aa  161  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 
423 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  28.22 
 
 
426 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 
426 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 
426 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3971  major facilitator transporter  27.59 
 
 
475 aa  117  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3590  major facilitator transporter  27.21 
 
 
474 aa  113  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0293443  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2382  major facilitator transporter  25.7 
 
 
466 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321963  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  25.06 
 
 
435 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  27.01 
 
 
441 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  25.67 
 
 
438 aa  103  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  23.99 
 
 
428 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  27.24 
 
 
432 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  24.82 
 
 
443 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  25.19 
 
 
448 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  25.13 
 
 
443 aa  100  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 
422 aa  99.8  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  26.67 
 
 
416 aa  99.8  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 
460 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 
413 aa  97.8  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  24.65 
 
 
440 aa  97.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  25.07 
 
 
439 aa  97.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  25.07 
 
 
439 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 
413 aa  96.7  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  25.07 
 
 
439 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 
434 aa  96.7  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  25.13 
 
 
447 aa  96.7  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.26 
 
 
460 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  24.77 
 
 
450 aa  96.3  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  27.03 
 
 
460 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  25.77 
 
 
405 aa  95.5  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  27.18 
 
 
433 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4023  glucarate transporter  25.06 
 
 
436 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.957782  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3916  probable glucarate transporter  25.06 
 
 
436 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  25.33 
 
 
439 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3978  putative glucarate transporter  25.06 
 
 
436 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.776069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4084  probable glucarate transporter  25.06 
 
 
436 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.463281  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  25 
 
 
466 aa  94  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 
422 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  26.1 
 
 
436 aa  94  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  24.11 
 
 
440 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  24.11 
 
 
440 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  24.87 
 
 
413 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  23.08 
 
 
449 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  23.49 
 
 
426 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43234  MFS family transporter: metabolite  24.71 
 
 
444 aa  92  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.104794 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43351  MFS family transporter: sugar  24.71 
 
 
444 aa  92  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4020  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 
435 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4133  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 
435 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  23.91 
 
 
445 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  23.3 
 
 
426 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43281  MFS family transporter: sugar  24.69 
 
 
488 aa  90.9  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210537  normal  0.0304903 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  26.65 
 
 
434 aa  90.1  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  26.41 
 
 
436 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  26.15 
 
 
438 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  23.62 
 
 
432 aa  89.7  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  22.55 
 
 
413 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  24.24 
 
 
438 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  27.72 
 
 
506 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  26.55 
 
 
436 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  24.94 
 
 
440 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  24.37 
 
 
451 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  27.18 
 
 
430 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0004  major facilitator transporter  23.56 
 
 
428 aa  87.8  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.44219  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  23.8 
 
 
446 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2535  major facilitator transporter  25.26 
 
 
425 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2587  major facilitator transporter  25.26 
 
 
425 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4990  major facilitator transporter  24.5 
 
 
431 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214245  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  28.48 
 
 
447 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 
427 aa  87.4  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2598  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 
420 aa  87  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  23.8 
 
 
446 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  23.5 
 
 
452 aa  86.7  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  26.09 
 
 
436 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  28.16 
 
 
447 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  23.38 
 
 
468 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  24.6 
 
 
436 aa  86.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  22.13 
 
 
405 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  25.24 
 
 
430 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  23.82 
 
 
441 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  23.75 
 
 
441 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  24.23 
 
 
442 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  23.82 
 
 
441 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  25 
 
 
475 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  22.39 
 
 
427 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36120  putative MFS transporter  26.05 
 
 
441 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263423 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  23.82 
 
 
441 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  23.82 
 
 
441 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  27.32 
 
 
442 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  23.82 
 
 
441 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  22.86 
 
 
424 aa  84.3  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  24.08 
 
 
454 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  27.55 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  21.82 
 
 
452 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>