More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0825 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 415 aa  807    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 442 aa  247  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  42.97 
 
 		 422 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  40.58 
 
 		 415 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  38.59 
 
 		 414 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  37.91 
 
 		 433 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  36.27 
 
 		 417 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 410 aa  186  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  37.9 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 		 410 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  35 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  36.19 
 
 		 414 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 416 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  34.46 
 
 		 416 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 401 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  38.04 
 
 		 419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  34.32 
 
 		 395 aa  166  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 		 409 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 432 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 403 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  31.36 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  31.11 
 
 		 402 aa  143  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  34.99 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 430 aa  135  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 		 411 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 399 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  32.87 
 
 		 416 aa  127  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 427 aa  122  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  26.9 
 
 		 434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 397 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 411 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 414 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 399 aa  101  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 421 aa  99.8  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  23.57 
 
 		 442 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 433 aa  99  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 486 aa  99  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  29.54 
 
 		 387 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  29.32 
 
 		 395 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 408 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  25.41 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  28.2 
 
 		 430 aa  94.7  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 414 aa  94.4  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  37.57 
 
 		 216 aa  94  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 441 aa  93.6  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 400 aa  93.6  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 420 aa  93.2  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 399 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0333  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 408 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 405 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 393 aa  90.9  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 422 aa  90.5  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  27.68 
 
 		 429 aa  90.5  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 459 aa  89.7  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  25.33 
 
 		 425 aa  89.7  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 426 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 434 aa  89.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 438 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 442 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 391 aa  89  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 413 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 409 aa  87.4  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  31.42 
 
 		 435 aa  87.4  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 421 aa  86.7  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  28.8 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  27.41 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2999  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  22.98 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>