More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3548 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 441 aa  846    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  55.95 
 
 		 433 aa  433  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  51.93 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  51.73 
 
 		 405 aa  378  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  52.43 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  51.62 
 
 		 438 aa  361  1e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  48.21 
 
 		 433 aa  360  3e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  47.93 
 
 		 431 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 442 aa  353  2e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  47.02 
 
 		 472 aa  351  1e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1057  major facilitator superfamily MFS_1  53.32 
 
 		 424 aa  332  7.000000000000001e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  47.94 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  47.45 
 
 		 427 aa  319  7e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  47.45 
 
 		 427 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  47.45 
 
 		 427 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  47.45 
 
 		 427 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  47.45 
 
 		 427 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  47.45 
 
 		 427 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  47.45 
 
 		 427 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  46.96 
 
 		 427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 427 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  44.5 
 
 		 427 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2897  major facilitator transporter  46.08 
 
 		 427 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388241  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0473  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 427 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.472982 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0500  major facilitator transporter  45.01 
 
 		 427 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0431  major facilitator transporter  45.59 
 
 		 427 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.592654  normal  0.379231 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0405  major facilitator transporter  45.59 
 
 		 427 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3588  major facilitator transporter  45.1 
 
 		 427 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.94844  normal  0.904194 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  42.03 
 
 		 428 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2605  major facilitator transporter  44.77 
 
 		 427 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  42.72 
 
 		 435 aa  286  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  41.19 
 
 		 432 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3966  major facilitator superfamily MFS_1  41.19 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  0.02436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  41.19 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  44.23 
 
 		 429 aa  279  9e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 435 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 427 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  43.87 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  42.6 
 
 		 436 aa  274  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  41.06 
 
 		 430 aa  273  5.000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  41.06 
 
 		 429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  41.9 
 
 		 432 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  41.06 
 
 		 425 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  42.52 
 
 		 418 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  39.21 
 
 		 430 aa  266  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  42.32 
 
 		 437 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  38.95 
 
 		 431 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  40.92 
 
 		 457 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0305  major facilitator superfamily MFS_1  43.17 
 
 		 432 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382232  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  38.76 
 
 		 431 aa  253  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 427 aa  252  9.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 422 aa  240  2.9999999999999997e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  39.43 
 
 		 409 aa  223  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 414 aa  123  7e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  28.87 
 
 		 414 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 400 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  29.66 
 
 		 407 aa  117  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  27 
 
 		 417 aa  116  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 406 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  27.05 
 
 		 434 aa  112  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 412 aa  110  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 452 aa  109  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 408 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 404 aa  109  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  29.38 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  27.34 
 
 		 413 aa  106  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 425 aa  106  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  29.62 
 
 		 528 aa  106  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  30.26 
 
 		 402 aa  106  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  28.53 
 
 		 412 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  28.57 
 
 		 402 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  26.08 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 412 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  28.71 
 
 		 452 aa  103  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  32.42 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 405 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  28.65 
 
 		 430 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 426 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 410 aa  99.8  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  30 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  30 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  30 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  30 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  30 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  30 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>