More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0513 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  85.31 
 
 		 431 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  86.01 
 
 		 431 aa  722    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  100 
 
 		 430 aa  850    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  61.63 
 
 		 430 aa  540  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  66.51 
 
 		 435 aa  535  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  61.16 
 
 		 429 aa  530  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  70.78 
 
 		 429 aa  529  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  64.27 
 
 		 457 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  64.47 
 
 		 427 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  63.83 
 
 		 427 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  64.68 
 
 		 425 aa  519  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  63.62 
 
 		 428 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  57.71 
 
 		 435 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  60.15 
 
 		 436 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  58.81 
 
 		 437 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  54.23 
 
 		 433 aa  432  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  55.98 
 
 		 427 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  51.55 
 
 		 428 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  51.07 
 
 		 427 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 428 aa  393  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  48.94 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  49.52 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 427 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3966  major facilitator superfamily MFS_1  49.52 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  0.02436 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  50.12 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  48.58 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  48.35 
 
 		 427 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  48.35 
 
 		 427 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  48.35 
 
 		 427 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  48.35 
 
 		 427 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  48.35 
 
 		 427 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  48.35 
 
 		 427 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  48.11 
 
 		 427 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2897  major facilitator transporter  47.6 
 
 		 427 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388241  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2605  major facilitator transporter  48.1 
 
 		 427 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0473  major facilitator transporter  48.56 
 
 		 427 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.472982 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0500  major facilitator transporter  48.33 
 
 		 427 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0405  major facilitator transporter  47.84 
 
 		 427 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0431  major facilitator transporter  47.47 
 
 		 427 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.592654  normal  0.379231 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3588  major facilitator transporter  47.84 
 
 		 427 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.94844  normal  0.904194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  48.48 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 418 aa  354  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0305  major facilitator superfamily MFS_1  51.11 
 
 		 432 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382232  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  46.38 
 
 		 424 aa  339  4e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  46.68 
 
 		 431 aa  339  5e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  45.75 
 
 		 405 aa  338  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  46.95 
 
 		 442 aa  332  6e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  42.96 
 
 		 433 aa  332  1e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  47.47 
 
 		 433 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  44.5 
 
 		 438 aa  323  5e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  46.12 
 
 		 442 aa  322  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  43.95 
 
 		 472 aa  311  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  42.07 
 
 		 422 aa  283  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  43.06 
 
 		 409 aa  282  7.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1057  major facilitator superfamily MFS_1  42.58 
 
 		 424 aa  276  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  39.44 
 
 		 441 aa  263  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 406 aa  142  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  28.54 
 
 		 452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 452 aa  134  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 402 aa  132  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 406 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 414 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  26.37 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 405 aa  127  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 403 aa  126  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 409 aa  124  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  26 
 
 		 436 aa  124  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  26.55 
 
 		 407 aa  123  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 400 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 409 aa  122  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 414 aa  116  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  26.17 
 
 		 412 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  28.39 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  26.86 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 402 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 410 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 410 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 408 aa  111  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 405 aa  111  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 410 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  24.68 
 
 		 405 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  27.5 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  25.13 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>